针对您提出的问题，即“同村村民给我一张村书记本人盖村委会章申请表，我办理了营业执照是否违法”，我们需要从多个角度来详细分析。
首先，从村干部经商办企业的角度来看，虽然法律并未明文禁止村干部经商办企业，但村干部作为基层群众性自治组织中从事管理的人员，在经商过程中必须严格遵守相关法律法规和纪律规定，不得以权谋私或利用职权、职务上的影响占用村集体资产、资源来办企业。这是《农村基层干部廉洁履行职责规定》等法规所明确要求的。
其次，关于村委会公章的管理和使用，根据相关法律法规和村民自治的原则，村委会公章应由村委会自行管理使用，而非由乡镇或其他外部机构代管。这是为了保障村民自治的权益和村委会的自治权。如果村委会公章被非法代管或滥用，不仅可能损害村民的利益，还可能违反相关法律法规。
现在，针对您具体的情况，如果这张申请表上的村委会公章是村书记合法、合规地加盖的，且您办理营业执照的行为没有违反其他相关法律法规（如工商注册、税务登记等方面的规定），那么从形式上看，您的行为并不直接构成违法。但是，这里有几个关键点需要注意：
公章加盖的合法性：您需要确认这张申请表上的村委会公章是否是村书记在合法、合规的情况下加盖的。如果公章的加盖存在违规或违法行为（如未经村民会议或村民代表会议同意、未按照规定程序加盖等），那么您的行为可能会因此受到牵连。
经商行为的合规性：即使公章加盖合法，您还需要确保自己的经商行为完全符合相关法律法规和纪律规定。这包括但不限于工商注册、税务登记、环保要求、安全生产等方面的规定。
避免利益冲突：作为同村村民，您还需要特别注意避免与村书记或村委会之间存在利益冲突或不当利益输送的情况。这可能会引发村民的质疑和不满，甚至可能违反相关法律法规和纪律规定。
综上所述，仅凭您目前提供的信息，无法直接判断您办理营业执照的行为是否违法。为了确保自己的行为合法合规，我建议您：
如果您在办理过程中遇到任何疑问或困难，建议及时咨询当地相关部门或专业律师的意见。