关于迟到扣除绩效奖金是否合法的问题，需结合具体情况综合判断，以下从多个角度为您详细分析：

1. 公司规章制度需合法有效
   若公司规章制度中明确规定了迟到扣除绩效奖金的条款，且该制度符合以下条件，则扣除行为可能合法：

   • 制定程序合法：需经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定；
     
   • 内容合法合理：扣除比例应与迟到情节、频率相适应，避免显失公平。例如，单次迟到扣除奖金不宜超过奖金总额的10%，频繁迟到可适当提高，但一般不超过30%；
     
   • 公示或告知员工：公司需将制度公示或告知员工，确保其知晓相关规定。
     

2. 劳动合同需明确约定
   若劳动合同中明确约定了员工迟到的处理方式和扣款标准，且该约定合理、合法并经员工同意，则公司可依据合同扣除奖金。若合同无相关规定或约定不明确，公司不得随意扣除。

3. 扣款金额需合理
   扣除的绩效奖金金额应与员工迟到的严重程度相匹配，且需满足以下限制：

   • 不得超过当月工资的20%：根据《工资支付暂行规定》，因员工本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%；
     
   • 扣除后工资不得低于最低工资标准：扣除后的工资不得低于当地最低工资标准，否则属于违法行为。
     

4. 执行扣款需公平公正
   公司在执行扣款时应遵循公平、公正原则，对同样的迟到情况应采取相同的处理方式，避免歧视或不公平现象。例如，不能因员工性别、年龄等因素差异而采取不同的扣款标准。

若公司扣除绩效奖金的行为不符合上述条件，员工可采取以下措施维护权益：

• 与公司协商沟通：首先尝试与公司协商，明确扣款依据是否合法合理；
  
• 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，要求公司纠正违法行为；
  
• 申请劳动仲裁：若投诉未果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自身权益。
  

举例说明：
假设某公司规章制度规定“单次迟到超过30分钟扣除当月绩效奖金的15%”，且该制度已公示并经职工代表大会讨论通过。若员工某月迟到一次且超过30分钟，公司扣除其15%的绩效奖金，且扣除后工资不低于当地最低工资标准，则该行为可能合法。反之，若公司无相关制度或制度未公示，或扣除比例过高导致工资低于最低标准，则员工有权维权。

温馨提示：
若您遇到类似情况，建议先查阅公司规章制度和劳动合同中的相关条款，再结合上述分析判断公司行为是否合法。如有疑问，可直接向我咨询，我将为您提供专业法律建议。