补发工资协议书在符合法律规定的情况下，是具有法律效力的。以下从多个角度为你详细分析：

协议书有效的基本条件

1. 双方真实意思表示：补发工资协议书必须是单位与员工双方真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫等情形。例如，单位不能以不补发工资就辞退员工等威胁手段，迫使员工签订协议书。
2. 内容合法合规：协议书的内容不能违反法律法规的强制性规定。比如，补发的工资数额不能低于当地最低工资标准，也不能存在其他违法违规的条款。
3. 形式要件：虽然法律没有明确规定补发工资协议书必须采用书面形式，但为了更好地证明双方的权利义务关系，建议采用书面形式，并由双方签字或盖章确认。

协议书有效的法律后果

1. 对单位的约束：一旦协议书生效，单位就必须按照协议书的约定补发工资。如果单位不履行，员工可以依据协议书向劳动仲裁机构申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，要求单位支付补发的工资及可能产生的违约金、赔偿金等。
2. 对员工的约束：员工在签订协议书后，也应按照协议书的约定履行自己的义务，比如不得再就同一事项向单位主张其他权利（除非协议书中有特别约定或者单位存在新的违法行为）。

协议书可能无效的情形

1. 主体不适格：如果签订协议书的单位不具备用工主体资格，或者员工不具备劳动者的主体资格（比如已达到退休年龄且享受养老保险待遇的人员），那么协议书可能因主体不适格而无效。
2. 内容违法：如果协议书的内容违反了法律法规的强制性规定，比如约定补发的工资低于当地最低工资标准，或者约定员工放弃某些法定权利等，那么这些条款是无效的。
3. 存在欺诈、胁迫等情形：如果单位在签订协议书时存在欺诈、胁迫等情形，导致员工在违背真实意愿的情况下签订了协议书，那么员工可以在法定期限内请求人民法院或者仲裁机构撤销该协议书。

建议

1. 签订前仔细审查：在签订补发工资协议书前，员工应仔细审查协议书的内容，确保自己的权益得到充分保障。如果有不明白的地方，可以及时向单位咨询或者寻求专业律师的帮助。
2. 保留相关证据：员工应保留好与补发工资相关的证据，比如工资条、银行转账记录、与单位的沟通记录等，以便在需要时证明自己的主张。
3. 及时主张权利：如果单位不按照协议书的约定补发工资，员工应及时向劳动仲裁机构申请仲裁或者向人民法院提起诉讼，以免超过诉讼时效而丧失胜诉权。

如果你在签订或履行补发工资协议书过程中遇到任何问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。