结论：一般情况下，不能先起诉被告履行合同，判决后再另行起诉被告承担违约金，但在特定情形下可以分开起诉。以下为你详细分析：
通常情况：一个诉讼中一并主张履行合同和违约金
在合同纠纷中，当一方不履行合同义务时，另一方作为守约方，通常可以在一个诉讼中同时主张要求对方履行合同以及承担违约金责任。这是因为这两项诉求往往基于同一个合同关系以及同一违约事实产生，具有紧密的关联性。
从法律原理上来说，合同履行和违约金承担都是违约责任的不同表现形式。合同履行旨在使合同恢复到原本应当实现的状态，保障合同目的的实现；而违约金则是对违约方违约行为的一种经济制裁，以补偿守约方因违约所遭受的损失。在一个诉讼中一并主张，有利于提高诉讼效率，减少当事人的诉累，也便于法院全面审查合同履行情况、违约事实以及违约金的合理性等因素，从而作出公正的判决。
例如，甲乙双方签订了一份买卖合同，约定甲向乙购买一批货物，乙应在合同约定的时间内交付货物，若乙逾期交付，需按照合同总价款的 10%向甲支付违约金。后乙逾期未交付货物，甲起诉至法院，此时甲可以在起诉状中同时要求乙履行交付货物的义务，并按照合同约定支付违约金。法院会在一审程序中对这两个诉求一并进行了审理和判决。
特殊情况：分开起诉的可行性
虽然一般情况下应在一个诉讼中主张履行合同和违约金，但在某些特殊情况下，分开起诉也是具有可行性的。
合同履行情况复杂且违约金计算需以履行结果为依据：如果合同的履行情况较为复杂，例如涉及多个阶段的履行、需要第三方配合履行等，且违约金的计算需要以合同最终履行结果作为依据，那么在合同履行情况尚未明确时，可能难以准确计算违约金数额。此时，当事人可以先就合同履行问题提起诉讼，待合同履行情况确定后，再根据实际情况另行起诉要求违约方承担违约金责任。
比如，甲乙双方签订了一份建设工程施工合同，约定甲将某工程项目发包给乙施工，工程竣工验收合格后，乙需在一定期限内提交完整的工程结算资料，甲在收到资料后进行审核并在规定时间内支付工程款。若乙逾期提交结算资料，需按照每日一定标准向甲支付违约金。在工程竣工后，双方就工程结算问题产生争议，乙迟迟未提交结算资料。此时，甲可以先起诉乙要求其提交工程结算资料以完成合同履行义务。待乙提交结算资料且工程款结算明确后，若乙确实存在逾期提交的违约行为，甲再另行起诉要求乙支付相应的违约金。
当事人基于诉讼策略考虑选择分开起诉：在某些情况下，当事人可能出于诉讼策略的考虑，选择先就合同履行问题提起诉讼，待取得有利于自己的判决结果后，再根据情况决定是否就违约金问题另行起诉。例如，当事人可能认为先解决合同履行问题能够更快地实现合同目的，或者担心在一个诉讼中同时主张履行合同和违约金会增加诉讼难度和风险等。不过，这种分开起诉的策略需要谨慎使用，因为可能会面临诉讼时效、证据保存等方面的问题，同时也可能增加当事人的诉讼成本和时间成本。
风险提示
如果选择分开起诉，需要注意诉讼时效的问题。根据法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在分开起诉的情况下，要确保每次起诉都在相应的诉讼时效期间内提出，否则可能会丧失胜诉权。
另外，分开起诉还可能导致证据收集和保存的难度增加。在不同的诉讼中，可能需要重复提供一些与合同履行和违约事实相关的证据，如果证据保管不善或者未能及时收集，可能会影响后续诉讼的结果。
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