民事判决认定的事实后被刑事判决认定存在冲突时，民事判决的处理方式需根据具体情况来判定，一般有以下几种处理路径：

1. 刑事判决对民事判决的直接影响：

   • 若刑事判决直接否定了民事判决中认定的事实，且该事实是民事判决的关键依据，那么民事判决的效力可能会受到质疑。在此情况下，当事人可以依据刑事判决的结果，向作出民事判决的法院申请再审，请求撤销或变更原民事判决。法院在审查后，若认为刑事判决确实影响了民事判决的正确性，会裁定再审，并根据再审结果作出新的判决。

2. 民事判决的相对独立性：

   • 并非所有刑事判决对民事判决认定事实的否定都会导致民事判决的撤销或变更。民事判决和刑事判决在证明标准、证明责任等方面存在差异。民事判决主要依据高度盖然性的证明标准，而刑事判决则要求达到排除合理怀疑的证明标准。因此，即使刑事判决认定了与民事判决不同的事实，也不一定意味着民事判决必然错误。法院在审查再审申请时，会综合考虑各种因素，包括证据的充分性、证明标准的适用等，来决定是否启动再审程序。

3. 当事人权利救济途径：

   • 对于当事人而言，如果认为民事判决因刑事判决的认定而受到影响，除了申请再审外，还可以考虑通过其他途径维护自己的权益。例如，如果民事判决中的赔偿金额等因刑事判决的认定而需要调整，当事人可以在刑事判决生效后，依据新的事实情况，向法院提起新的民事诉讼或申请执行异议等，以寻求合理的赔偿或解决方案。

4. 法院的审查与判断：

   • 法院在处理此类案件时，会秉持公正、公平的原则，对民事判决和刑事判决进行全面、客观的审查。法院会仔细分析刑事判决对民事判决认定事实的影响程度，以及这种影响是否足以导致民事判决的撤销或变更。同时，法院也会充分考虑当事人的合法权益，确保处理结果的公正性和合理性。

举例说明：假设在一起民事纠纷中，法院依据当事人提供的证据认定了某一事实，并据此作出了民事判决。然而，在后续的刑事诉讼中，法院经过审理认为该事实并不成立，并作出了相应的刑事判决。在此情况下，如果当事人认为民事判决因刑事判决的认定而受到影响，可以向作出民事判决的法院申请再审。法院在审查后，若认为刑事判决确实否定了民事判决中的关键事实，且该事实对民事判决的结果具有决定性影响，那么法院会裁定再审，并根据再审结果作出新的判决。

建议：面对此类复杂情况，建议你及时咨询专业律师，以便更准确地评估案件情况，制定合适的应对策略。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。