结论：公司业务使用个人微信付款是否违法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、从公司财务管理和税务合规角度
公司财务管理制度：
- 正常情况下，公司业务应当使用公司账户进行资金往来，这是公司财务管理的基本要求。使用个人微信付款，可能导致公司财务记录不完整、不准确，影响公司财务管理的规范性和透明度。
- 如果公司有明确的财务管理制度禁止使用个人账户进行业务付款，那么使用个人微信付款就违反了公司内部规定，可能面临公司内部的纪律处分或责任追究。
税务合规性：
- 使用个人微信付款，可能使得公司业务收入或支出无法准确反映在公司的税务申报中，导致税务申报不实，存在税务风险。
- 税务机关在核查公司税务情况时，如果发现公司使用个人账户进行业务往来，可能会对公司进行税务调查，甚至处以罚款等税务处罚。
二、从法律责任角度
民事责任：
- 如果使用个人微信付款导致公司与其他主体之间的交易关系不明确或产生纠纷，公司可能需要承担因交易关系不清而产生的民事责任。
- 例如，如果公司使用个人微信向供应商付款，但供应商否认收到款项或主张款项性质与合同约定不符，公司可能需要通过法律途径解决纠纷，并承担相应的诉讼费用和可能的赔偿责任。
刑事责任（极端情况）：
- 在极端情况下，如果使用个人微信付款涉及挪用资金、职务侵占等违法行为，相关责任人可能面临刑事责任追究。
- 例如，如果公司员工利用职务便利，使用个人微信将公司资金非法占为己有，数额较大的，可能构成职务侵占罪，需要承担刑事责任。
三、建议与措施
完善公司财务管理制度：
- 公司应明确规定业务付款应使用公司账户进行，禁止使用个人账户进行业务往来。
- 加强对公司员工的财务培训，提高员工的财务合规意识。
加强税务合规管理：
- 公司应确保所有业务收入和支出都准确反映在税务申报中，避免使用个人账户进行税务规避。
- 定期与税务机关沟通，了解税务政策变化，确保公司税务合规。
及时整改与补救：
- 如果公司已经存在使用个人微信付款的情况，应尽快进行整改，将相关资金往来纳入公司财务记录。
- 如因使用个人微信付款导致税务问题或法律纠纷，应及时咨询专业律师，采取补救措施，降低损失。
总结：公司业务使用个人微信付款存在多方面的法律风险，包括财务管理不规范、税务合规问题以及可能的民事和刑事责任。因此，建议公司严格遵守财务管理和税务合规要求，避免使用个人账户进行业务往来。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。