结论：针对您提出的“签订合同的公司在签订合同时已注销结算变成其他公司如何起诉”的问题，这确实是一个涉及合同主体变更及诉讼主体确定的复杂法律问题。以下是我从多个角度为您详细分析并给出的建议。
一、合同主体的变更与诉讼主体的确定
合同主体的变更：
- 在合同签订时，如果一方公司已经注销，那么该合同在法律上可能被视为无效或存在瑕疵，因为注销的公司已经失去了法律上的主体资格，无法再承担合同义务或享有合同权利。
- 如果公司在合同签订后注销，但合同是在公司注销前签订的，且合同内容不违反法律法规的强制性规定，那么合同仍然有效。但此时，合同的履行和诉讼主体的确定就变得复杂起来。
诉讼主体的确定：
- 如果公司注销后，其权利义务由其他公司承继（如通过合并、分立等方式），那么新的公司应作为诉讼主体参与诉讼。
- 如果公司注销后，没有明确的权利义务承继者，或者承继者不明确，那么可能需要考虑将公司的股东、发起人等作为诉讼主体，但这需要根据具体情况和法律规定来判断。
二、起诉的具体步骤与建议
收集证据：
- 收集与合同签订、履行相关的所有证据，包括合同文本、付款凭证、交货凭证、沟通记录等。
- 收集公司注销的相关证据，如注销公告、清算报告等，以证明公司在合同签订时的状态或合同签订后的变更情况。
确定诉讼主体：
- 根据上述合同主体变更和诉讼主体确定的分析，明确应该起诉谁。
- 如果不确定诉讼主体，可以咨询专业律师或向法院申请调查令，以获取更多关于公司注销和权利义务承继的信息。
撰写起诉状：
- 起诉状应明确被告的身份信息、诉讼请求、事实和理由等。
- 在事实和理由部分，应详细阐述合同签订、履行的情况，以及公司注销对合同履行和诉讼主体确定的影响。
向法院提起诉讼：
- 将起诉状和相关证据提交给有管辖权的法院。
- 缴纳诉讼费用，并等待法院的受理和开庭通知。
三、可能遇到的法律问题与应对
合同效力问题：
- 如果合同被认定为无效或存在瑕疵，可能需要通过其他法律途径（如协商、调解、仲裁等）来解决纠纷。
- 在诉讼过程中，可以主张合同有效并要求对方履行合同义务，或者主张合同无效并要求对方承担缔约过失责任等。
诉讼主体适格问题：
- 如果被告提出诉讼主体不适格的抗辩，需要提供充分的证据证明诉讼主体的适格性。
- 可以根据法律规定和案件事实，主张新的公司或股东、发起人等作为诉讼主体，并说明理由。
四、建议与总结
- 建议：在处理此类复杂法律问题时，建议您寻求专业律师的帮助。律师可以根据您的具体情况和法律规定，为您提供更具体、更专业的法律建议和指导。
- 总结：签订合同的公司在签订合同时已注销结算变成其他公司的情况确实复杂，但通过收集证据、确定诉讼主体、撰写起诉状并向法院提起诉讼等步骤，您仍然可以维护自己的合法权益。同时，也要做好应对可能遇到的法律问题的准备。
如果您有任何进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。