结论：单位扣岗位工资调到底薪是否合法，需根据具体情况判断，包括劳动合同的约定、单位规章制度是否合法以及调整工资的原因等。以下从不同角度进行分析：
一、劳动合同的约定
若劳动合同中有明确约定：
- 如果劳动合同中明确规定了岗位工资和底薪的具体数额或计算方式，并且约定了单位在何种情况下可以调整工资，那么单位在符合约定条件的情况下调整工资可能是合法的。
- 但需注意：即使劳动合同中有相关约定，该约定也必须符合法律法规的规定，不能违反劳动法的强制性规定，如最低工资标准等。
若劳动合同中无明确约定：
- 如果劳动合同中没有明确规定岗位工资和底薪的具体数额或计算方式，或者没有约定单位可以调整工资的条件，那么单位单方面扣岗位工资调到底薪可能缺乏合法依据。
二、单位规章制度的合法性
规章制度需经民主程序制定：
- 根据《劳动合同法》的规定，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 如果单位的规章制度未经民主程序制定，或者未向劳动者公示，那么该规章制度可能不具有法律效力，单位依据该规章制度调整工资可能不合法。
规章制度内容需合法：
- 单位的规章制度内容必须符合法律法规的规定，不能违反劳动法的强制性规定。例如，规章制度中不能规定低于当地最低工资标准的工资数额。
三、调整工资的原因
因劳动者原因调整：
- 如果劳动者存在严重违反单位规章制度、不能胜任工作等情形，单位根据相关规定调整其工资可能是合法的。但需注意，单位需提供充分证据证明劳动者存在相关情形，并且调整工资需符合劳动合同或规章制度的约定。
因单位经营原因调整：
- 如果单位因经营困难、市场变化等原因需要调整工资，需与劳动者协商一致，并签订书面协议。未经劳动者同意，单位单方面调整工资可能不合法。
四、法律建议
审查劳动合同和规章制度：
- 劳动者应仔细审查自己的劳动合同和单位的规章制度，了解其中关于工资调整的规定。
与单位协商：
- 如果劳动者对单位的工资调整有异议，应首先与单位进行协商，表达自己的诉求和理由。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
示例：假设劳动者小张与单位签订的劳动合同中明确规定了岗位工资和底薪的具体数额，并且约定了单位在劳动者不能胜任工作时可以调整工资。后来，小张因工作表现不佳被单位认为不能胜任工作，单位决定将其岗位工资扣除并调到底薪。在此情况下，如果单位能提供充分证据证明小张不能胜任工作，并且调整工资符合劳动合同的约定，那么该调整可能是合法的。但如果单位无法提供充分证据或调整工资违反了劳动合同的约定，那么小张有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
最后，每个案件的具体情况都有所不同，如果你对单位的工资调整有异议或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。