结论：合同是否可以从第二项开始付款，这主要取决于合同双方的具体约定以及合同条款的合法性和合理性。以下从不同角度进行分析：
合同约定优先：
- 合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。如果合同中明确约定了付款方式、付款顺序或付款条件，那么双方应当按照合同约定履行。
- 如果合同中明确规定了付款应从第二项开始，或者规定了特定的付款顺序，那么只要这种约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就是有效的，双方应当遵守。
合同未明确约定时的处理：
- 如果合同中没有明确约定付款应从哪一项开始，或者约定不明确，那么双方应当协商确定。协商不成的，可以根据合同的性质、目的和交易习惯等因素，按照公平、合理的原则确定。
- 在这种情况下，如果一方主张从第二项开始付款，而另一方不同意，那么主张方需要提供充分的证据来证明其主张的合理性，比如合同的目的、交易习惯、行业惯例等。
法律后果与风险提示：
- 如果一方违反合同约定，擅自改变付款顺序或方式，可能构成违约行为，需要承担违约责任，包括赔偿对方因此遭受的损失。
- 因此，在签订合同时，双方应当明确约定付款方式、付款顺序等关键条款，以避免后续纠纷。如果合同已经签订，但发现存在模糊或不明确的地方，建议及时协商补充协议或进行法律咨询，以确保合同的顺利履行。
建议：
- 在签订合同时，务必仔细阅读合同条款，特别是关于付款方式、付款顺序等关键部分，确保双方对合同内容有清晰、一致的理解。
- 如果对合同条款有疑问或不确定的地方，建议及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。
- 在合同履行过程中，如果遇到任何问题或纠纷，也应及时咨询律师，以便及时采取措施维护自己的合法权益。
如有任何合同纠纷方面的法律问题，可以直接向我咨询。