当法定代表人起诉公司时，公司应由除法定代表人外的其他负责人或指定代表来应诉。这一结论基于公司治理结构和诉讼程序的基本原则，旨在确保诉讼的公正性和有效性。以下从不同角度详细分析：
一、法定代表人起诉公司的法律背景
法定代表人作为公司的法律代表，通常负责代表公司行使职权和承担义务。然而，当法定代表人与公司之间发生纠纷，且该纠纷基于其个人名义进行的民事行为时，法定代表人与公司之间的地位变为平等。此时，法定代表人有权以个人名义起诉公司，要求公司承担相应的民事责任。
二、公司应诉的主体确定
其他负责人代表：
- 在法定代表人起诉公司的诉讼中，由于法定代表人本身是原告，因此不能由其代表公司应诉。此时，公司应由除法定代表人外的其他负责人，如董事长（若非法定代表人）、副董事长、总经理等高级管理人员代表公司参与诉讼。
- 这些负责人应具备相应的法律知识和诉讼经验，能够代表公司有效维护合法权益。
指定代表应诉：
- 若公司无其他合适的负责人，或现有负责人与案件存在利害关系，可能影响公正应诉的，公司可通过股东会、董事会等决策程序临时指定一名代表，并出具授权委托书，以公司名义参加诉讼。
- 指定代表应具备独立性和公正性，能够客观、全面地代表公司利益进行应诉。
三、公司应诉的注意事项
及时委托律师：
- 无论是由其他负责人还是指定代表应诉，公司都应及时委托专业律师提供法律支持。律师能够为公司提供专业的法律意见和诉讼策略，确保公司在诉讼过程中处于有利地位。
准备充分证据：
- 公司应积极收集、整理与案件相关的证据材料，包括合同、协议、会议记录、财务凭证等。这些证据将有助于证明公司的立场和主张，为应诉提供有力支持。
遵守诉讼程序：
- 公司应严格遵守诉讼程序的规定，按时提交答辩状、证据材料等诉讼文件。同时，公司应积极配合法院的调查和审理工作，确保诉讼的顺利进行。
四、可能的法律后果
- 若公司未能及时、有效地应诉，可能导致法院作出不利于公司的判决。这可能包括赔偿损失、履行合同义务等。因此，公司应高度重视法定代表人起诉公司的诉讼案件，积极采取措施进行应诉。
五、实际案例参考
- 假设某公司法定代表人因与公司存在股权纠纷而起诉公司。在此情况下，公司应由除法定代表人外的其他负责人（如副董事长）或指定代表（如通过股东会决议指定的独立董事）代表公司应诉。同时，公司应委托专业律师提供法律支持，并准备充分的证据材料来证明公司的立场和主张。
总结来看，当法定代表人起诉公司时，公司应由除法定代表人外的其他负责人或指定代表来应诉。公司应积极采取措施进行应诉，包括及时委托律师、准备充分证据、遵守诉讼程序等，以确保公司的合法权益得到有效维护。如有任何疑问或需要进一步的法律支持，请直接向我咨询。