若公司退付手续费的时间已过但尚未退付，您可以按照以下步骤处理：

1. 核查合同与协议
   首先，仔细查阅您与公司签订的合同、协议或相关条款，确认其中关于手续费退付的具体约定，包括退付条件、时间限制、违约责任等。这是后续维权的重要依据。

2. 与公司沟通协商
   若合同中有明确约定但公司未履行，建议先以书面形式（如邮件、信函）与公司沟通，明确指出其未按时退付手续费的事实，并要求其按照约定履行退付义务。沟通时注意保留证据，如沟通记录、公司回复等。

3. 发送律师函或正式通知
   若沟通无果，您可以考虑委托律师起草并发送律师函，正式要求公司履行退付义务。律师函具有法律威慑力，可能促使公司主动解决问题。

4. 向监管部门投诉
   如果公司涉及行业监管（如金融、保险等），您可以向相关监管部门投诉，反映公司未按时退付手续费的问题。监管部门可能会介入调查，并督促公司整改。

5. 提起诉讼或仲裁
   若上述方式均无效，您可以根据合同中的争议解决条款，向法院提起诉讼或申请仲裁，要求公司退付手续费并承担违约责任（如支付违约金、赔偿损失等）。诉讼或仲裁是最终的法律救济途径，但需注意诉讼时效问题（一般为3年，自知道或应当知道权利受损之日起计算）。

温馨提示：

• 在处理过程中，务必保留好所有相关证据，如合同、付款凭证、沟通记录等。
  
• 若涉及金额较大或情况复杂，建议及时咨询专业律师，制定更详细的维权策略。
  

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