结论：工资包含单位缴纳的五险一金部分，这种做法本身不直接违法，但需满足“实发工资不低于当地最低工资标准”这一核心前提，且需明确工资构成与扣除方式。 以下从法律逻辑、实务操作、风险提示三个角度展开分析：

一、法律逻辑：工资与五险一金的“包含关系”需满足“最低工资底线”

根据《最低工资规定》（原劳动保障部令第21号）第十二条，用人单位支付给劳动者的工资，在剔除“五险一金”中个人应缴纳部分后，不得低于当地最低工资标准。但法律未禁止单位将“单位缴纳的五险一金部分”计入工资总额（即“应发工资”），只要最终劳动者到手的“实发工资”不低于最低工资即可。
举例：若当地最低工资为2000元/月，劳动者应发工资为5000元（含单位缴纳的五险一金2000元、个人缴纳的五险一金1000元、实发工资2000元），此时单位未违法；但若应发工资为3000元（含单位缴纳的五险一金2000元、个人缴纳的500元、实发工资500元），则因实发工资低于最低工资而违法。

二、实务操作：需明确工资构成与扣除方式，避免“模糊扣减”

实务中，单位常将“五险一金单位缴纳部分”计入工资总额（即“应发工资”），再从中扣除个人应缴部分后发放实发工资。这种操作本身合法，但需满足两个条件：

1. 工资构成透明：劳动合同或工资条中需明确标注“应发工资=基本工资+单位缴纳的五险一金+其他补贴”“实发工资=应发工资-个人缴纳的五险一金-其他扣款”，避免以“工资包含单位缴纳部分”为由变相降低实发工资；
   
2. 扣除比例合规：个人缴纳的五险一金比例需符合当地规定（如养老保险个人8%、医疗保险个人2%等），单位不得擅自提高个人扣缴比例或额外扣款。

三、风险提示：警惕单位以“工资包含单位缴纳部分”为由损害劳动者权益

若单位存在以下行为，则可能违法：

1. 以“工资包含单位缴纳部分”为由，拒绝支付加班费、经济补偿等：例如，单位称“你的工资已包含单位缴纳的五险一金，因此加班费不再额外计算”，这违反了《劳动法》第四十四条关于加班费计算的规定（加班费应以“实发工资”或“应发工资中扣除非常规奖金后的部分”为基数计算）；
   
2. 通过“工资包含单位缴纳部分”变相降低实发工资：例如，单位将原本应由单位承担的五险一金费用转嫁给劳动者，导致实发工资低于最低工资标准，这属于“未足额支付劳动报酬”，劳动者可依据《劳动合同法》第三十八条解除合同并主张经济补偿。

建议：若您发现单位以“工资包含单位缴纳部分”为由损害您的权益（如实发工资低于最低工资、拒付加班费等），可要求单位提供工资构成明细，或向当地劳动监察部门投诉。如有具体纠纷，可直接向我咨询，我会结合您的工资条、劳动合同等材料进一步分析。