结论：自动离职后公司少发工资是违法的，劳动者有权要求公司支付应得的工资，并可通过法律途径维护自身权益。
法律依据与解析
工资支付义务：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，无论劳动者是否按照公司规定的流程离职，只要其提供了正常劳动，用人单位就有义务支付相应工资。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条也明确规定，用人单位未按照劳动合同的约定或国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
经济损失赔偿与工资支付区分：
- 如果劳动者自动离职给用人单位造成了经济损失，用人单位可以要求劳动者赔偿经济损失。但这一赔偿与支付劳动者应得工资是两个不同的法律关系，不能混为一谈，也不能以此为由拒绝支付工资。
- 经济损失的赔偿可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。
劳动者权益与维权途径
劳动者权益：
- 劳动者有取得劳动报酬的权利，这是受法律保护的。即便是自动离职，对于已经付出劳动的部分，用人单位也应按照约定支付相应工资。
维权途径：
- 协商：首先尝试与公司协商解决，向公司说明其做法的违法性，要求支付工资。
- 投诉：若协商不成，可以向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令公司限期支付工资。
- 劳动仲裁与诉讼：申请劳动仲裁是另一种有效的维权方式。在仲裁过程中，劳动者需要提供相关证据（如劳动合同、工资条、考勤记录等）以证明自己的工作情况和应得工资数额。若对仲裁结果不满意，还可以向人民法院提起诉讼，进一步维护自己的合法权益。
实际操作建议
- 保存证据：劳动者应保存好与工作相关的证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以便在维权时提供证明。
- 及时行动：一旦发现公司少发工资，劳动者应及时与公司沟通或采取法律行动，避免超过时效限制。
- 理性维权：在维权过程中，劳动者应保持冷静和理性，通过合法途径表达自己的诉求，避免采取过激行为。
总结：自动离职后公司少发工资是明确违反法律规定的。劳动者不仅有权要求支付工资，还可以通过多种法律途径来维护自己的合法权益。在处理此类问题时，劳动者应保持冷静，收集好相关证据，并依法行事。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。