痔疮手术收费3万余元是否合法，需结合以下因素综合判断，不能一概而论：

1. 医疗项目与收费依据
   根据《全国医疗服务项目技术规范》及地方医保目录，痔疮手术费用通常包含手术费、麻醉费、材料费、药品费、护理费等。若医院严格按照物价部门核定的项目收费（如使用特殊器械、进口材料或合并其他治疗），且费用明细清晰可查，则可能合法；但若存在分解收费、重复收费或虚构项目（如将普通手术包装为“高端微创”），则涉嫌违法。

2. 医院性质与定价权限

   • 公立医院：需执行政府指导价，收费项目需经卫健委和物价部门备案，超出标准部分可能违规；
     
   • 私立医院：可自主定价，但需在显著位置公示收费标准，并确保患者知情同意。若未履行告知义务或存在欺诈，患者可主张退款或赔偿。

3. 患者知情权与选择权
   根据《民法典》第1219条，医疗机构需向患者说明病情、医疗措施及费用，患者有权选择治疗方案。若医院未提前告知总费用或术中擅自增加项目（如“术中发现其他问题需额外处理”），可能侵犯患者知情权，患者可据此维权。

建议行动步骤：

1. 要求医院提供详细费用清单，核对每一项收费的合理性（如材料费是否与实际使用一致）；
   
2. 查询当地物价部门或卫健委官网，确认手术项目及耗材的政府指导价；
   
3. 若发现违规收费，可向医院医务科投诉，或向当地卫健委、市场监管局举报，必要时通过诉讼主张退款及赔偿。

如有进一步细节（如医院类型、收费明细等），可向我补充说明，我会为您具体分析。