合同中约定工资包括加班费，在一定条件下是合法的，但必须符合相关法律法规的规定。以下是对这一问题的详细分析：
合法性条件
自愿协商：
- 双方必须在平等、自愿的基础上进行协商，确保合同内容真实反映双方的意愿。任何一方不得强迫对方接受不合理的条款。
合理计算：
- 加班费的计算必须符合国家规定的标准。具体来说，工作日加班应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付；休息日加班且不能安排补休的，应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付；法定休假日加班的，应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付。
明确告知：
- 用人单位必须向劳动者明确说明工资构成中包含加班费的情况，避免事后产生争议。这通常要求在劳动合同中明确写明工资包含加班费，并在工资条等文件中详细列明加班费的计算方式和金额。
不低于最低工资标准：
- 折算后的正常工作时间工资不得低于当地最低工资标准。这是保障劳动者基本生活需求的重要原则。
法律风险
补足差额：
- 如果用人单位未依法支付加班费，或者约定的加班费低于国家规定的标准，劳动者有权要求用人单位补足差额部分。
举证责任：
- 在发生劳动争议时，用人单位需要承担举证责任，证明其已经按照法律规定支付了加班费。如果无法提供充分证据，可能面临败诉的风险。
实践中的注意事项
合同条款清晰：
- 在劳动合同中应明确约定工资构成、加班费计算方式及支付时间等关键条款，避免模糊不清导致后续纠纷。例如，可以写明“月工资XX元，其中包含正常工作时间工资XX元及加班费XX元，加班费按照国家规定标准计算”。
保留证据：
- 用人单位应妥善保存考勤记录、工资支付凭证等证据材料，以便在必要时证明其已经依法支付了加班费。这些证据材料对于维护用人单位的合法权益至关重要。
合规操作：
- 用人单位应严格遵守国家关于工作时间和休息休假的规定，合理安排劳动者的工作时间和休息时间，避免过度加班。过度加班不仅可能损害劳动者的身心健康，还可能引发劳动争议和法律风险。
实例说明
假设某公司与员工签订的劳动合同中明确约定：“月工资为6000元，其中包含正常工作时间工资4000元及加班费2000元（按照国家规定标准计算）。”若该员工在某月加班了若干小时，且公司按照约定的计算方式和标准支付了加班费，同时员工的实际收入不低于按照法定标准计算的应得收入，则这种约定是合法有效的。然而，如果公司未按照约定支付加班费或支付的金额低于法定标准，那么员工有权要求公司补足差额或采取其他法律措施维护自己的权益。
总结与建议：
合同中约定工资包括加班费在一定条件下是合法的，但必须满足自愿协商、合理计算、明确告知和不低于最低工资标准等条件。作为劳动者，在签订劳动合同时应仔细审查合同条款，确保自己的合法权益得到保障。如果合同中存在关于工资包含加班费的约定，应要求用人单位提供充分的证据来证明其合法性，并确保折算后的正常工作时间工资不低于当地最低工资标准。在发生争议时，可以依法维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。