结论：公司放5天假但扣3天工资的做法是否合理，需分情况讨论。若扣除的3天中包含法定节假日（5月1日），则不合理；若扣除的均为调休休息日且公司未安排补休，则可能合理但需符合特定条件。以下为详细分析：

一、法定节假日（5月1日）的工资支付规定

根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条第三项规定，法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。五一劳动节中，5月1日为法定节假日，用人单位必须支付劳动者当天工资，且不得以调休或其他形式代替。因此，若公司扣除的3天中包含5月1日，则该做法明显违法，劳动者有权要求公司补发当天工资。

二、调休休息日（如5月2日至5月5日）的工资支付规定

除5月1日外，五一假期的其他日期通常通过调休形成休息日。对于这些调休休息日，根据《劳动法》第四十四条第二项规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。这意味着：

1. 若公司安排补休：劳动者在调休休息日未工作，公司无需支付加班费，也不应扣除工资。若公司扣除工资且未安排补休，则涉嫌违法。
2. 若公司未安排补休且扣除工资：需进一步分析扣除原因。若公司以“未出勤”为由扣除工资，但劳动者实际因公司放假未工作，则扣除行为缺乏法律依据，劳动者可要求公司返还工资。

三、公司行为的合法性判断及建议

1. 若扣除的3天中包含5月1日：

   • 违法性：公司必须支付5月1日工资，扣除行为违法。
   • 劳动者行动：可与公司协商补发工资，或向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁。

2. 若扣除的3天均为调休休息日：

   • 需核实公司政策：若公司明确放假且未要求劳动者工作，扣除工资无依据；若公司要求劳动者工作但未安排补休，则应支付两倍工资而非扣除。
   • 劳动者行动：与公司沟通确认放假安排及工资扣除原因，要求公司出具书面说明。若公司无法合理解释，可依法维权。

四、计算公式（若涉及加班费计算）

若公司要求劳动者在调休休息日工作且未安排补休，加班费计算公式为：

\[ \text{加班费} = \text{日工资} \times 200\% \times \text{加班天数} \]

其中，日工资计算公式为：

\[ \text{日工资} = \frac{\text{月工资收入}}{\text{月计薪天数}} \quad (\text{月计薪天数通常为21.75天}) \]

五、总结与建议

1. 核实放假性质：确认公司扣除的3天是否包含法定节假日或调休休息日。
2. 保留证据：保存工资条、放假通知等证据，以备维权之需。
3. 依法维权：若公司行为违法，可先协商解决；协商无果的，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

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