结论前置：在工地干活时，发工资一般不应扣除所谓的“安全运营费”。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律角度
工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这意味着，工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位不得随意扣除。
扣除工资的合法情形：
- 用人单位可以扣除劳动者工资的情形通常限于：代扣代缴个人所得税、社会保险费用、法院判决或裁定要求代扣的抚养费或赡养费，以及法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。“安全运营费”并不属于这些合法扣除的情形。
违法扣除工资的后果：
- 如果用人单位违法扣除劳动者工资，劳动者有权向劳动行政部门投诉，劳动行政部门将责令用人单位限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
二、实际操作角度
合同约定：
- 如果劳动合同中明确约定了“安全运营费”的扣除，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么用人单位可能有权按照合同约定扣除。但这种情况非常罕见，且合同条款必须合法合规。
公司规章制度：
- 即使公司规章制度中规定了“安全运营费”的扣除，但如果该规章制度未经民主程序制定、未公示或未告知劳动者，或者与法律、行政法规相抵触，那么该规章制度对劳动者不具有约束力，用人单位不能据此扣除工资。
劳动者权益保护：
- 劳动者在面对用人单位违法扣除工资时，应勇敢维护自己的合法权益。可以与用人单位协商解决，协商不成的，可以向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁。
三、建议与提醒
保留证据：
- 劳动者应妥善保管与工资支付相关的证据，如工资条、银行转账记录、劳动合同等，以便在发生纠纷时证明自己的主张。
及时咨询：
- 如果对工资扣除有疑问或不满，建议及时咨询专业律师或劳动行政部门，了解自己的权益和维权途径。
谨慎签订合同：
- 在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资支付和扣除的条款，确保自己的权益不受侵害。
总结来说，在工地干活时，发工资一般不应扣除所谓的“安全运营费”。如果用人单位试图扣除，劳动者应了解自己的权益和维权途径，并勇敢维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动工伤或工资福利方面的问题，欢迎直接向我咨询。