您好，关于农田种植药材是否合法的问题，这主要取决于药材的种类以及种植土地的性质和用途。

首先，对于一般中药材（罂粟、大麻等特殊药材除外）的种植，通常是不需要办理特定证件的，因此从这一层面来说，种植一般中药材在农田上是合法的。但这里需要明确的是，农田的主要用途是用于粮食和棉、油、糖、蔬菜等农产品及饲草饲料的生产，这是由《中华人民共和国粮食安全保障法》所明确的。

接下来，我们根据土地利用现状分类标准和具体实践来进一步分析：

1. 如果农田直接利用地表耕作层种植药材，且每年种植一季及以上，例如按照“每年种植一季”耕种方式种植半夏、蒲公英、沙参、白术等多年生药材，这样的土地在国土调查中通常会被认定为耕地。在这种情况下，种植药材是符合耕地利用规定的，因此是合法的。

2. 如果农田直接利用地表耕作层种植药材，但种植周期在一年以上（不含一年），例如种植西洋参、三七等，这样的土地在国土调查中则会被认定为园地。虽然这并不意味着种植这些药材就是非法的，但需要注意的是，如果原本属于耕地的土地被变更为园地用于种植长期药材，可能需要遵循相关的土地变更和用途管制规定。特别是在“三调”及后续开展的年度国土变更调查中，对于在耕地上种植长期药材的地块，会按“园地”变更地类并标注“即可恢复”属性。如果该地块不再种植药材并恢复耕种符合耕地认定标准的作物后，年度国土变更调查将及时将其变更为“耕地”。

此外，国家也高度重视中药材产业的发展，并在确保粮食安全的前提下，积极支持各地合理利用土地资源，优化种植布局，为中药材种植业的发展创造良好的政策环境和空间。

总结来说：

• 种植一般中药材（特殊药材除外）在农田上通常是合法的，但需遵循农田的主要用途规定。
• 如果种植的药材符合耕地认定标准（如每年种植一季及以上），则直接利用农田种植是合法的。
• 如果种植的药材种植周期较长（一年以上），土地可能被认定为园地，此时需遵循土地变更和用途管制规定。
• 国家支持中药材产业的发展，并在政策上给予一定扶持。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。