结论：三方协议写的是朋友的个体工商户，但自己实际在有限责任公司上班，这种情况是否会产生影响，主要取决于协议的具体内容、双方的实际履行情况以及是否存在欺诈等违法行为。以下从不同角度进行详细分析：
一、协议内容与实际履行情况
若三方协议中未明确约定工作单位或岗位的具体信息：
- 在这种情况下，即使协议上写的是朋友的个体工商户，而你实际在有限责任公司上班，也不太可能构成违约或违法行为。因为协议本身并未对工作单位或岗位做出具体限制。
若三方协议中明确约定了工作单位或岗位：
- 若你未告知实际工作单位：这可能构成对协议的违反，尤其是如果协议中有关于工作单位或岗位的明确约定，并且这一约定是协议的重要条款之一。此时，另一方（如学校或招聘单位）可能有权要求你承担违约责任，如赔偿损失等。
- 若你已告知实际工作单位，且各方均无异议：在这种情况下，虽然协议上写的是朋友的个体工商户，但实际履行中各方已经达成了新的共识，因此不太可能产生法律纠纷。
二、是否存在欺诈等违法行为
若你故意隐瞒实际工作单位，以欺诈手段签订三方协议：
- 这可能构成欺诈行为，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，欺诈行为可能导致合同无效或被撤销。此外，如果欺诈行为涉及金额较大或情节严重，还可能构成犯罪，需要承担刑事责任。
若你并非故意隐瞒，而是由于疏忽或误解导致协议内容与实际不符：
- 在这种情况下，你不太可能承担欺诈的法律责任。但为了避免纠纷，建议你及时与协议各方沟通，说明实际情况，并协商修改协议内容。
三、法律建议
- 审查三方协议的具体内容：仔细阅读协议中的各项条款，特别是关于工作单位、岗位、违约责任等方面的约定。
- 与协议各方沟通：如果你发现协议内容与实际不符，或者存在其他疑问，建议及时与协议各方（如学校、招聘单位、朋友等）沟通，说明实际情况，并协商解决方案。
- 保留相关证据：在沟通过程中，注意保留相关证据（如聊天记录、邮件等），以便在发生纠纷时能够证明自己的立场和主张。
- 寻求法律帮助：如果你对协议内容、法律责任等方面存在疑问或担忧，建议及时咨询专业律师（如我），以便获得更具体、更专业的法律建议。
最后，三方协议是具有法律效力的文件，签订前应仔细审查协议内容，确保自己的权益得到保障。如果在实际履行过程中发现协议内容与实际不符，应及时与协议各方沟通并协商解决方案。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。