关于您提出的“签三方是否可以盖合作社的章”的问题，这是一个涉及法律要点和实际操作的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、合作社的法律地位与权限
首先，我们需要明确合作社的法律地位。农民专业合作社是在农村家庭承包经营基础上成立的互助性经济组织，它依法登记后取得法人资格，这意味着合作社具有独立的民事主体地位，能够以自己的名义从事民事活动，包括签订和履行三方协议。因此，从法律地位上来说，合作社是有资格在三方协议上盖章的。
二、三方协议的内容与合作社业务范围
然而，是否可以在三方协议上盖合作社的章，还取决于协议的具体内容。如果三方协议的内容与合作社的业务经营范围相关，比如涉及农产品的种植、收购、销售等合作事项，那么合作社作为协议的一方主体，承担相应的权利和义务，其盖章行为是合适且具有法律效力的。但如果协议内容超出了合作社的业务经营范围，比如涉及到金融投资、房地产开发等与农业生产经营无关的业务，合作社就需要谨慎对待了，因为此类行为可能带来法律风险。
三、盖章的程序与效力
除了考虑协议内容和合作社业务范围外，盖章的程序也是影响协议效力的关键因素。合作社盖章应当遵循其内部的章程和规定，确保盖章行为经过了合作社法定代表人的授权或者符合合作社内部关于重大事项决策的程序。这样，盖章行为才能代表合作社的真实意思表示，具有法律效力。同时，还需要确保其他两方对合作社的参与和盖章没有异议，并且协议内容合法、有效。
四、实际操作建议
在实际操作中，我建议您采取以下步骤来确保三方协议的合法性和有效性：
综上所述，三方协议在某些情况下是可以盖合作社的章的，但这取决于协议的具体内容、合作社的法律地位和权限、盖章的程序以及其他方的同意情况。希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。