可以申请征信异议，但能否成功需结合具体情况判断。以下从不同角度展开分析：

1. 法律依据角度
   根据《征信业管理条例》第二十五条，信息主体认为征信机构采集、保存、提供的信息存在错误、遗漏的，有权向征信机构或信息提供者提出异议并要求更正。银行作为信息提供者，若因扣款通知不及时导致系统记录的还款时间与实际还款时间不符（如未及时扣款但未通知用户，导致系统显示逾期），属于信息错误情形，用户可依法提出异议申请。

2. 银行过错认定角度
   需重点证明银行存在过错：

• 通知义务违反：需提供证据证明银行未按合同约定或监管要求履行通知义务（如短信、邮件未发送，或发送时间晚于扣款日）；
  
• 因果关系：需证明逾期记录直接由银行通知不及时导致（如用户已在扣款日前存入足额资金，但因未收到通知未主动查询账户状态，导致银行未扣款成功）。
  若银行能证明已履行通知义务（如系统显示通知已发送），或用户存在其他过错（如未保持联系方式畅通、未主动查询账户），则异议申请可能被驳回。

1. 操作建议角度
   

• 证据收集：保存扣款日前账户余额截图、银行通知记录（或缺失记录）、还款凭证等，证明已履行还款义务；
  
• 异议流程：向银行或征信机构提交书面异议申请，说明事实与理由，并附证据材料；
  
• 后续跟进：若异议未获支持，可向中国人民银行征信中心申请个人声明，或通过诉讼要求银行消除不良记录（需以银行存在过错为前提）。

总结：银行扣款通知不及时导致逾期，用户有权申请征信异议，但需通过证据证明银行存在过错且该过错与逾期记录存在直接因果关系。建议优先与银行协商，协商不成再通过异议申请或法律途径解决。