调解协议约定的还款期限延长是合法的，但需要满足一定的条件并遵循相应的程序。以下从不同角度为你详细分析：

合法性基础

1. 意思自治原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体从事民事活动，应当遵循自愿原则，按照自己的意思设立、变更、终止民事法律关系。因此，如果双方当事人在平等、自愿的基础上，协商一致同意延长还款期限，这是完全合法的。

2. 合同变更：调解协议本质上也是一种合同。根据合同法的相关规定，当事人协商一致，可以变更合同。所以，双方同意延长还款期限，实际上就是对原调解协议的一种变更，这种变更是受到法律保护的。

操作程序

1. 双方协商：首先，双方需要就延长还款期限的事宜进行协商，并达成一致意见。这是延长还款期限的前提和基础。

2. 签订书面协议：为了确保双方的权益，建议将协商结果以书面形式固定下来，即签订一份新的协议或者对原调解协议进行补充约定，明确延长后的还款期限以及其他相关条款。

3. 可能需要的公证或见证：虽然不是必须，但为了增加协议的法律效力和可执行性，双方可以考虑对新的协议进行公证或者邀请第三方进行见证。

注意事项

1. 不损害第三方利益：在延长还款期限时，需要确保不会损害到其他债权人的利益。如果调解协议涉及多个债权人或者存在担保等情况，延长还款期限可能需要得到其他债权人的同意或者遵循特定的法律程序。

2. 遵守法律法规：在延长还款期限的过程中，双方需要遵守相关的法律法规，不得利用延长还款期限来逃避债务或者进行其他违法行为。

3. 及时履行新协议：一旦双方就延长还款期限达成一致并签订了新的协议，就需要按照新的协议来履行还款义务。如果一方未能按时履行，另一方有权依法追究其违约责任。

举例说明：假设甲和乙之间有一份调解协议，约定甲应在某日前向乙偿还10万元。后来，由于甲资金周转困难，双方协商一致同意将还款期限延长3个月。在这种情况下，只要双方签订了书面协议并明确了新的还款期限，这种延长就是合法的。

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