结论：强拆被确认违法后，依据的协议并不必然应当撤销，是否撤销需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、协议撤销的法律依据
《民法典》相关规定：
- 根据《民法典》第一百四十八条至第一百五十一条，若协议是在一方以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立的，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
- 若协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者违背公序良俗，该协议无效，而非撤销。但在此情境下，若协议因强拆违法而涉及非法内容，同样可能面临无效或被撤销的风险。
拆迁相关法规：
- 在拆迁过程中，若拆迁方与被拆迁方签订的协议是基于违法强拆行为而达成的，该协议可能因缺乏合法基础而面临撤销或无效的风险。特别是当强拆行为被确认违法后，协议中的补偿条款、安置方案等可能因拆迁行为的违法性而失去合法依据。
二、协议撤销的实践考量
协议签订时的情境：
- 若协议是在被拆迁方受到强拆威胁或实际遭受强拆后，在极度不公平或胁迫的情况下签订的，该协议很可能因违背被拆迁方的真实意愿而被撤销。
- 若协议签订时双方处于平等地位，且协议内容合法、合理，即使强拆行为后来被确认违法，该协议也不一定被撤销。
协议内容的合法性：
- 若协议内容本身违反法律法规的强制性规定，如补偿标准低于法定最低标准、安置方案不符合规划要求等，该协议可能因违法而无效或被撤销。
- 若协议内容合法，仅因强拆行为的违法性而面临撤销风险，则需根据具体情况判断协议是否应被撤销。
撤销协议的后果：
- 撤销协议后，双方应恢复原状，即拆迁方应返还因协议获得的财产或利益，被拆迁方应返还已获得的补偿或安置。
- 若撤销协议导致一方遭受损失，受损方有权要求对方赔偿损失。
三、建议与行动
收集证据：
- 若您认为协议应被撤销，建议收集相关证据，如强拆行为的违法证据、协议签订时的情境证据（如录音、录像、证人证言等）、协议内容违法的证据等。
咨询专业律师：
- 在决定是否撤销协议前，建议您咨询专业律师，对协议内容、签订情境、强拆行为等进行全面评估，以确定协议是否应被撤销及撤销后的法律后果。
提起诉讼或申请仲裁：
- 若您决定撤销协议，可通过向人民法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁的方式来实现。在诉讼或仲裁过程中，您需提供充分证据证明协议应被撤销的理由。
进一步思考：在处理此类问题时，还需考虑协议签订后的履行情况、双方是否已有其他约定或行为等因素。因此，在决定是否撤销协议前，务必进行全面、细致的评估和分析。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。