关于教师编制签了三方协议约定五万违约金是否合理的问题，结论前置：这需要结合具体情况来判断，不能一概而论地说正常或不正常。以下从不同角度为你详细分析：
从法律规定角度
违约金设定的合法性基础：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者约定违约金的情形主要限于两种：一是用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以约定服务期及违约金；二是用人单位与劳动者约定竞业限制条款的，可以约定违约金。
- 在教师编制的三方协议中，如果并未涉及上述两种情形，那么约定五万违约金可能缺乏直接的法律依据，其合法性会受到质疑。
违约金数额的合理性：
- 即使存在可以约定违约金的情形，违约金的数额也应当合理，不能过高或过低。五万违约金的数额是否合理，需要结合培训费用、竞业限制补偿等实际情况来判断。
- 如果违约金数额明显高于实际损失，劳动者可以请求法院或仲裁机构予以适当减少。
从实际情况角度
三方协议的性质：
- 三方协议通常涉及学校、毕业生和用人单位三方，其性质更接近于预约合同，即约定在将来一定期限内订立正式的劳动合同。
- 如果三方协议中约定的违约金过高，可能会对毕业生的就业选择造成不必要的限制，也不符合公平原则。
地区和行业差异：
- 不同地区和行业对于违约金的约定可能存在差异。在一些地区或行业，五万违约金可能被视为合理，而在另一些地区或行业则可能被视为过高。
- 因此，在判断违约金是否合理时，还需要考虑当地的经济水平、行业惯例等因素。
法律建议
审查三方协议：
- 如果你已经签订了三方协议并约定了五万违约金，建议仔细审查协议内容，特别是关于违约金的条款，确保其合法性和合理性。
协商与调解：
- 如果认为违约金过高或不合理，可以尝试与用人单位进行协商，寻求达成一个双方都能接受的解决方案。
- 如果协商不成，也可以考虑向当地的劳动争议调解组织申请调解。
法律途径：
- 如果调解无果，你可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，请求确认违约金条款无效或予以适当减少。
最后需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，因此在处理类似问题时，建议根据实际情况咨询专业律师（即向我咨询），以便获得更具体、更准确的法律建议。