核心结论：员工在工作中严重违章而发生工伤，员工仍可享受工伤保险待遇，但用人单位可依据内部规章制度对员工进行相应处理，同时用人单位若未尽到安全管理义务也可能需承担一定责任。以下是详细分析：
员工享受工伤保险待遇不受违章影响
- 根据《工伤保险条例》规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。只要员工与用人单位存在劳动关系，且符合工伤认定条件（在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害等），即使员工存在严重违章行为，也不影响其工伤认定及享受工伤保险待遇。这是因为工伤保险实行无过错责任原则，旨在保障受伤职工获得及时的医疗救治和经济补偿。
- 例如，员工在操作机器时未按照操作规程佩戴防护用具，导致手指被机器压伤，这种情况依然可以被认定为工伤，员工可以享受工伤医疗费用报销、停工留薪期工资等工伤保险待遇。
用人单位可依据内部规章制度对员工进行处理
- 虽然员工的违章行为不影响工伤认定，但用人单位有权根据依法制定的规章制度对员工的违章行为进行相应处理。这些处理措施可以包括警告、罚款、降职、解除劳动合同等，具体取决于违章行为的严重程度以及规章制度的规定。
- 不过，用人单位在依据规章制度处理员工时，需要确保规章制度的内容合法、制定程序合法，并且已经向员工公示或告知。例如，用人单位的规章制度中明确规定“严重违反操作规程导致事故发生的，给予解除劳动合同处理”，且该规章制度经过职工代表大会或者全体职工讨论，与工会或者职工代表平等协商确定，并向员工进行了公示，那么在员工出现严重违章行为时，用人单位可以依据该规定解除劳动合同。
用人单位未尽到安全管理义务可能需担责
- 如果用人单位在安全生产管理方面存在漏洞，未为员工提供必要的安全培训、安全防护设备，或者未对工作场所的安全隐患进行及时排查和整改，导致员工因严重违章而发生工伤事故，用人单位可能需要承担相应的法律责任。
- 根据《安全生产法》等相关法律法规，用人单位有义务保障员工的人身安全，提供安全的工作环境和条件。如果因用人单位的过错导致工伤事故发生，除了员工可以享受工伤保险待遇外，用人单位还可能面临行政处罚，如罚款、责令停产停业整顿等；在严重情况下，如果用人单位的行为构成犯罪，相关责任人还可能被追究刑事责任。例如，用人单位未对员工进行安全培训，员工因不熟悉操作规程而发生工伤事故，安全生产监督管理部门可以对用人单位处以罚款等行政处罚。