结论：在约定三年内分批结清，但实际履行超过三年的情况下，优先受偿权的起算时间通常取决于合同的具体约定、履行情况以及相关法律规定，一般可能从最后一期债务履行期限届满之日起算，但也可能因具体情况而有所不同。以下从不同角度进行详细分析：

1. 合同约定优先：

   • 如果合同中明确约定了优先受偿权的起算时间，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么应当按照合同约定来确定起算时间。例如，合同可能约定从最后一期债务履行期限届满之日起算优先受偿权，或者约定在某个特定事件发生后起算。

2. 最后一期债务履行期限届满之日：

   • 在没有明确约定优先受偿权起算时间的情况下，如果合同是分批履行，且每批债务的履行期限都明确，那么通常可以从最后一期债务履行期限届满之日起算优先受偿权。这是因为，在最后一期债务履行期限届满后，债权人的全部债权才得以确定，此时开始计算优先受偿权更为合理。

3. 实际履行情况的影响：

   • 如果实际履行情况与合同约定不符，例如债务人未按照约定的期限履行债务，或者债权人同意债务人延期履行等，那么优先受偿权的起算时间可能会受到影响。在这种情况下，需要根据实际履行情况，结合合同约定和相关法律规定，来确定优先受偿权的起算时间。

4. 相关法律规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律规定，优先受偿权的起算时间可能受到诉讼时效、保证期间等制度的影响。例如，如果债权人在诉讼时效期间内未行使优先受偿权，那么可能会丧失该权利。因此，在确定优先受偿权起算时间时，还需要考虑相关法律规定的限制。

法律建议：

• 在处理此类问题时，建议首先仔细审查合同条款，明确合同中关于优先受偿权的约定。
• 如果合同中没有明确约定，或者约定不明确，那么需要结合实际履行情况和相关法律规定来综合判断。
• 在必要时，可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保障。

可能后果：

• 如果优先受偿权的起算时间确定不当，可能会导致债权人丧失优先受偿的权利，或者面临其他不利的法律后果。
• 因此，在确定优先受偿权起算时间时，需要谨慎对待，确保自己的权益不受损害。

如有更多关于合同纠纷的法律问题，可以直接向我咨询。