针对机动车检验检测公司违反《道路交通安全法》第十三条，无理由拒绝年检的情况，应由市场监督管理部门进行处理。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据与部门职责：

   • 《道路交通安全法》第十三条主要规定了机动车安全技术检验的相关要求，包括检验机构应当按照国家机动车安全技术检验标准对机动车进行检验，对检验结果负责，并不得刁难检验对象等。
   • 市场监督管理部门负责机动车安全技术检验机构的资质认定和监督管理工作。当检验机构存在违法行为，如无理由拒绝年检时，市场监督管理部门有权依据相关法律法规进行调查处理。

2. 处理流程与措施：

   • 如果车主或相关方认为机动车检验检测公司存在无理由拒绝年检的违法行为，可以向当地市场监督管理部门进行投诉或举报。
   • 市场监督管理部门在接到投诉或举报后，会依法进行调查核实。如果确认检验机构存在违法行为，会依法采取相应的处理措施，如警告、罚款、撤销资质等。

3. 车主的权益与救济途径：

   • 车主有权要求机动车检验检测公司按照法律法规和检验标准进行年检，不得无理由拒绝。
   • 如果车主的权益受到侵害，除了向市场监督管理部门投诉外，还可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，如提起民事诉讼要求赔偿损失等。

4. 特殊情况与注意事项：

   • 在某些特殊情况下，如车辆存在严重安全隐患或未按照规定进行维修保养等，检验机构可能会依据相关法律法规和检验标准拒绝年检。但这种情况应当有明确的法律依据和合理的理由，并且应当向车主说明原因。
   • 车主在年检前应当确保车辆符合相关法律法规和检验标准的要求，如携带有效的行驶证、保险单等证件，以及确保车辆的安全技术状况良好等。

建议：如果车主遇到机动车检验检测公司无理由拒绝年检的情况，首先应当保持冷静，了解相关法律法规和检验标准的要求。然后，可以向当地市场监督管理部门进行投诉或举报，并保留好相关证据以便后续维权。如果问题复杂或涉及较大金额的损失，建议车主及时咨询专业律师以获取更全面的法律帮助。

希望以上分析能对您有所帮助。如果您还有其他关于交通事故赔偿或刑事辩护方面的问题，欢迎直接向我咨询。