您好，关于行政处罚程序立案后几日可以做出行政处罚的问题，这主要取决于案件的具体情况、行政机关的办案流程以及相关法律法规的要求。以下是我为您详细梳理的解答：

一、一般期限

根据《中华人民共和国行政处罚法》第六十条的规定，行政机关应当自行政处罚案件立案之日起九十日内作出行政处罚决定。这一规定是为了确保行政效率，及时对违法行为进行处理，并保障当事人的合法权益，防止案件久拖不决。

二、特殊情况下的延期

1. 案情复杂需延期：

   • 如果案件情况比较复杂，不能在规定期限内作出行政处罚决定的，经行政机关负责人批准，可以延长办案期限。
   • 延长期限一般不得超过三十日。这种情况通常适用于涉及多个当事人、多种违法行为交织，或者需要大量调查取证、专业鉴定等复杂情况的案件。

2. 报请上级批准：

   • 在某些特别复杂的案件中，如果需要更长时间进行调查和处理，行政机关可以报请上级行政机关或者有关部门批准后进一步延长办案期限。
   • 但最长延长期限仍不得超过三十日（具体可能因地区或案件类型有所不同，需以实际规定为准）。

三、法律、法规、规章的特别规定

• 如果特定领域的法律法规（如食品药品安全、环境保护、治安管理等领域）对行政处罚决定的作出期限有特别规定，则应遵循这些特别法的规定。
• 例如，《治安管理处罚法》第九十九条规定，公安机关办理治安案件的期限，自受理之日起不得超过三十日；案情重大、复杂的，经上一级公安机关批准，可以延长三十日。虽然这里表述为“受理之日”，但在实际执法中受理和立案环节紧密相关，且该规定明确了治安案件不同于一般行政处罚案件的办理期限。

四、实际影响因素

• 证据收集难度：证据的收集是行政处罚过程中的关键环节。如果证据分散、难以获取，或者需要进行大量的调查走访、数据调取等工作，会耗费较多时间。
• 当事人配合程度：当事人的配合程度也会影响案件办理的进度。如果当事人积极配合调查，如实提供相关信息和材料，有助于行政机关尽快查明事实；反之，如果当事人拒绝配合、逃避调查，可能会导致案件办理时间延长。
• 行政机关内部流程：不同行政机关的内部工作流程和工作效率也可能存在差异。一些行政机关可能存在审批环节繁琐、人员配备不足等问题，导致案件办理速度较慢。此外，如果遇到法定节假日、不可抗力等因素，也会相应顺延案件办理期限。

五、建议与指导

• 如果您面临的具体情况比较复杂，或者担心时间可能会有延误，建议咨询专业的法律顾问。他们可以根据您的具体情况提供针对性的法律意见和指导。
• 您也可以直接与负责处理的行政机关进行沟通，了解案件的具体进展和预计的处理时间，以便更好地维护自己的合法权益。

综上所述，行政机关在立案后作出行政处罚决定的一般期限是90日，但在案情复杂或法律有特殊规定的情况下，这一期限可能会有所调整。因此，在处理相关事务时，应充分了解相关法律法规和具体规定，并适时寻求专业帮助。