结论：旅游大巴有三证但没有合同的情况下，处罚措施并非固定不变，而是会根据具体违法情形、情节严重程度以及相关法律法规的规定来综合确定。以下是从不同角度进行的分析：
一、合同缺失的法律后果
合同的重要性：
- 合同是明确双方权利和义务的法律文件，对于旅游大巴服务而言，合同能够详细规定服务内容、费用、责任划分等关键条款。
- 缺乏合同可能导致双方在服务过程中产生争议时，缺乏明确的法律依据来解决问题。
合同缺失的处罚：
- 单纯从合同缺失的角度来看，并不直接构成违法行为，因此不会直接受到行政处罚。
- 但合同缺失可能使得旅游大巴服务提供者在发生纠纷时面临举证困难，从而可能承担不利的法律后果。
二、可能涉及的违法行为及处罚
未取得经营许可或超越许可范围经营：
- 如果旅游大巴服务提供者虽然有三证（通常指道路运输经营许可证、车辆行驶证、驾驶员从业资格证），但未按照许可的范围或条件提供服务，可能构成违法行为。
- 根据《中华人民共和国道路运输条例》等相关法律法规，这种违法行为可能面临罚款、没收违法所得、责令停止经营等处罚。
其他违法行为：
- 如果旅游大巴服务提供者在提供服务过程中存在其他违法行为，如超载、疲劳驾驶、使用不合格车辆等，也将受到相应的行政处罚。
- 这些处罚措施可能包括罚款、扣分、吊销驾驶证或经营许可证等。
三、实际处罚的考量因素
违法情节的严重程度：
- 处罚措施的轻重通常与违法情节的严重程度成正比。情节越严重，处罚越严厉。
是否造成实际危害：
- 如果违法行为没有造成实际危害或后果轻微，处罚可能相对较轻。
- 如果违法行为导致了严重后果，如交通事故、人员伤亡等，处罚将更加严厉。
是否配合调查和处理：
- 如果旅游大巴服务提供者能够积极配合相关部门的调查和处理工作，如实陈述事实、提供证据等，可能在一定程度上减轻处罚。
四、建议与措施
尽快补签合同：
- 为了避免潜在的纠纷和法律风险，旅游大巴服务提供者应尽快与乘客或相关方补签合同，明确双方的权利和义务。
加强合规管理：
- 旅游大巴服务提供者应加强内部合规管理，确保所有经营活动都符合相关法律法规的规定。
- 定期对车辆进行维护和检查，确保车辆符合安全标准；对驾驶员进行培训和考核，提高其安全意识和驾驶技能。
积极应对调查和处理：
- 如果面临相关部门的调查和处理，旅游大巴服务提供者应积极配合，如实陈述事实、提供证据等。
- 如有必要，可以寻求专业律师的帮助，以维护自身合法权益。
有问题直接向我咨询，作为专业律师，我将根据具体情况为你提供更详细的法律建议和帮助。