结论：小区有人违建导致全小区房屋被冻结交易，这一做法是否合法需分情况讨论，一般情况下，仅因部分业主违建就冻结全小区房屋交易是不合法的，但在特定情形下，如违建行为严重影响小区整体规划或存在重大安全隐患，相关部门可能依法采取限制措施。以下从不同角度详细分析：
一、违建与房屋交易冻结的直接关联性
违建行为的法律性质：违建，即违反城乡规划、土地管理等法律法规，未经批准擅自建设的建筑物或构筑物。违建行为本身是违法的，但违建行为人通常是具体的业主或建设单位，而非整个小区。
房屋交易冻结的法律依据：房屋交易冻结通常是由相关部门（如房管局、规划局等）根据法律法规的规定，对特定房屋或小区采取的限制交易措施。这种措施通常针对的是存在违法违规行为、影响公共利益或存在安全隐患的房屋。
直接关联性分析：一般情况下，仅因小区内部分业主存在违建行为，就冻结整个小区的房屋交易，缺乏直接的法律依据。因为违建行为是局部的，而房屋交易冻结是全局性的，两者之间缺乏直接的因果关系。
二、可能存在的合法情形
违建行为严重影响小区整体规划：如果违建行为严重破坏了小区的整体规划，影响了小区的居住环境和公共利益，相关部门在依法调查取证后，可能认为有必要对整个小区的房屋交易进行限制，以促使违建业主整改或接受处罚。但这种情况下，冻结交易仍需有明确的法律依据和合理的程序。
违建行为存在重大安全隐患：如果违建行为存在重大安全隐患，如影响建筑结构安全、消防安全等，相关部门为了保障公共安全，可能依法采取限制交易措施。但同样，这种措施需要基于充分的调查和评估，并遵循法定程序。
三、非法冻结交易的法律后果
侵犯业主合法权益：如果相关部门未经法定程序，擅自冻结整个小区的房屋交易，可能侵犯了业主的合法权益，包括财产权、交易权等。业主有权依法维权，要求相关部门解除冻结措施并赔偿损失。
行政责任与法律责任：相关部门如果滥用职权，擅自冻结房屋交易，可能面临行政责任甚至法律责任。根据《行政处罚法》等相关法律法规的规定，行政机关在行使职权时必须遵循法定程序，否则可能构成违法行政。
四、建议与措施
了解冻结原因：如果小区房屋被冻结交易，业主应首先了解冻结的具体原因和依据。可以向相关部门咨询或申请信息公开，以获取冻结措施的详细信息和法律依据。
依法维权：如果认为冻结措施缺乏法律依据或程序违法，业主可以依法向相关部门提出异议或申请行政复议、提起行政诉讼等，以维护自己的合法权益。
配合整改：如果冻结措施是由于小区内存在违建行为导致的，业主应积极配合相关部门进行整改工作，以促使违建业主整改或接受处罚，从而解除冻结措施。
作为彭文静律师，我建议业主在遇到此类问题时，保持冷静并依法维权。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。