针对您提出的“公司拿出的假指纹、假签名鉴定为真，该怎么办”的问题，这确实是一个涉及证据真实性和法律程序的关键问题。以下是我从多个角度为您提供的分析和建议：

1. 质疑鉴定结论的真实性与合法性：

   • 真实性：首先，您需要确认鉴定机构是否具备相应的资质，以及鉴定过程是否遵循了科学、客观、公正的原则。如果鉴定机构或鉴定人员存在违规行为，如与一方有利害关系、未按照法定程序进行鉴定等，那么鉴定结论的真实性就会受到质疑。
   • 合法性：检查鉴定结论是否依法出具，包括是否由有资质的鉴定机构出具、是否加盖了鉴定机构的公章、鉴定人员是否签名等。如果鉴定结论在形式上存在瑕疵，也可能影响其法律效力。

2. 申请重新鉴定或补充鉴定：

   • 重新鉴定：如果您对鉴定结论有异议，且认为原鉴定机构或鉴定人员存在违规行为或鉴定结论明显依据不足，您可以向法院申请重新鉴定。重新鉴定应由另一家有资质的鉴定机构进行，以确保鉴定结果的公正性和准确性。
   • 补充鉴定：如果原鉴定结论存在遗漏或不明确之处，您也可以申请补充鉴定，以完善鉴定结论，使其更加全面、准确地反映案件事实。

3. 收集其他证据以支持您的主张：

   • 物证：除了指纹和签名外，您还可以收集其他物证，如合同文本、交易记录、通信记录等，以证明您的主张。
   • 人证：寻找目击者或了解案件情况的人作为证人，他们的证言可能对证明案件事实起到关键作用。
   • 专家意见：如果案件涉及专业领域的知识，您可以聘请相关领域的专家出具意见，以支持您的主张。

4. 法律程序与救济途径：

   • 提起诉讼或反诉：如果您认为公司的行为侵犯了您的合法权益，您可以向法院提起诉讼或反诉，要求公司承担相应的法律责任。
   • 申请证据保全：在诉讼过程中，如果您担心关键证据可能灭失或以后难以取得，您可以向法院申请证据保全，以确保证据的完整性和可证明性。
   • 利用法律程序进行质证：在庭审过程中，您有权对对方提出的证据进行质证，包括质疑鉴定结论的真实性和合法性。通过质证，您可以揭示对方证据的瑕疵或不足，从而削弱其证明力。

5. 注意事项与风险提示：

   • 及时行动：一旦发现公司拿出的假指纹、假签名被鉴定为真，您应尽快采取行动，以免错过法律救济的时机。
   • 保留证据：在采取任何行动之前，请确保您已妥善保留所有相关证据，包括原始文件、通信记录、鉴定结论等。
   • 咨询专业律师：虽然我在这里为您提供了一些分析和建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在采取任何法律行动之前，我建议您直接向我咨询，以便我能根据您的具体情况提供更具体、更专业的法律建议。

面对公司拿出的假指纹、假签名被鉴定为真的情况，您应首先质疑鉴定结论的真实性与合法性，然后考虑申请重新鉴定或补充鉴定，同时积极收集其他证据以支持您的主张。在法律程序方面，您可以提起诉讼或反诉、申请证据保全以及利用法律程序进行质证。最后，请注意及时行动、保留证据并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。