结论：公司两个月没发工资，您自离时公司不能仅扣当月工资，公司拖欠工资的行为已违反法律规定，您有权要求公司支付全部拖欠工资，并可能因此获得经济补偿。

详细分析：

1. 公司拖欠工资的法律责任：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。” 公司两个月未发工资，显然违反了这一规定。
   • 拖欠工资不仅损害了劳动者的合法权益，也破坏了劳动关系的和谐稳定。因此，公司需要承担相应的法律责任。

2. 自离时工资的处理：

   • 自离，即劳动者未经公司同意，擅自离职。但自离并不意味着公司可以克扣或拖欠劳动者的工资。
   • 无论劳动者是否自离，公司都应按照实际工作天数和约定的工资标准支付工资。因此，公司不能仅扣当月工资，而应支付全部拖欠的工资。

3. 经济补偿的可能性：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条：“用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：……（二）未及时足额支付劳动报酬的；……” 在公司拖欠工资的情况下，您有权解除劳动合同。
   • 同时，根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条：“有下列情形之一的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿：（一）劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的；……” 因此，您可能因公司拖欠工资而获得经济补偿。

4. 建议行动：

   • 与公司协商：首先，您可以尝试与公司协商，要求公司支付拖欠的工资，并协商经济补偿事宜。
   • 申请劳动仲裁：如果协商无果，您可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司支付拖欠的工资和经济补偿。
   • 提起诉讼：如果对劳动仲裁结果不满意，您还可以向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

后续行动中需要的知识或建议：

• 在与公司协商或申请劳动仲裁时，您需要准备相关证据，如工资条、工作记录、劳动合同等，以证明公司拖欠工资的事实。
• 了解劳动仲裁和诉讼的流程和规定，以便更好地维护自己的权益。
• 如果您对法律程序不熟悉，可以寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分保障。

可能的法律后果：

• 如果公司被认定拖欠工资，将面临支付拖欠工资、经济补偿以及可能的罚款等法律后果。
• 如果您因公司拖欠工资而解除劳动合同，并符合经济补偿的条件，公司将需要向您支付经济补偿。

总之，公司两个月没发工资，您自离时公司不能仅扣当月工资。您有权要求公司支付全部拖欠工资，并可能因此获得经济补偿。如有需要，请随时向我咨询相关法律问题。