核心结论：在工程款质保金未到期，但想通过顶房留住房源的情况下，需签订一份详细、明确的协议，以保障双方权益，该协议可命名为《以房抵工程款及质保金留房协议》（具体名称可双方协商确定），协议内容应涵盖以下几个关键方面：

1. 协议主体信息：

   • 明确协议双方（即发包方与承包方）的名称、法定代表人或负责人信息、联系方式等，确保协议主体的合法性与准确性。

2. 工程概况与质保金情况：

   • 简要描述工程的基本情况，包括工程名称、地点、规模等。
   • 明确质保金的金额、支付时间、支付方式以及质保期限等关键信息，确保双方对质保金的情况有清晰的认识。

3. 以房抵款条款：

   • 详细描述用于抵款的房屋信息，包括房屋地址、面积、户型、产权状况等。
   • 明确房屋的价值评估方式及抵款金额，确保抵款金额与工程款及质保金总额相匹配。
   • 规定房屋交付的时间、条件及方式，包括房屋的交付状态（如毛坯房、精装修房等）、交付时需提供的文件等。

4. 质保金留房特别约定：

   • 鉴于质保金未到期，需在协议中明确留住房源的具体安排，如房屋在质保金到期前的使用、管理、维护等责任归属。
   • 约定质保金到期后，若工程无质量问题，房屋产权的正式转移方式及时间；若工程存在质量问题，质保金的处理方式及房屋产权的转移是否受影响等。

5. 违约责任与争议解决：

   • 明确双方违反协议约定时应承担的违约责任，包括违约金、赔偿损失等。
   • 约定争议解决的方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等，并明确管辖法院或仲裁机构。

6. 其他条款：

   • 根据实际情况，可添加其他必要的条款，如保密条款、通知与送达条款等，以确保协议的完整性和可操作性。

建议：在签订协议前，双方应充分沟通，确保对协议内容无异议。协议签订后，应妥善保管，并按照协议约定履行各自义务。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，可直接向我咨询。