结论前置：合伙后成立公司，是否还可以依据合伙协议起诉，这主要取决于合伙协议的内容、公司成立后的法律关系变化以及具体纠纷的性质。以下从不同角度进行分析：
合伙协议与公司章程的关系：
- 合伙协议是合伙人之间设立合伙企业、明确各自权利和义务的协议。而公司章程则是公司成立后，规定公司组织及活动基本规则的文件。
- 如果合伙人在成立公司时，将合伙协议中的关键条款（如出资比例、利润分配、决策机制等）转化为公司章程的内容，并且公司章程的效力得到了所有股东的认可，那么在公司运营过程中，应主要依据公司章程来处理股东之间的纠纷。
- 但若合伙协议中存在某些特殊约定，且这些约定并未被公司章程所涵盖或替代，同时这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么在特定情况下，合伙人仍可能依据合伙协议中的这些特殊约定来主张权利。
纠纷性质与法律依据：
- 如果纠纷涉及的是合伙人之间在公司成立前的合伙事务，如出资纠纷、利润分配纠纷等，且这些纠纷在合伙协议中有明确约定，那么合伙人可以依据合伙协议向法院提起诉讼。
- 如果纠纷涉及的是公司成立后的运营事务，如股东权益纠纷、公司治理纠纷等，那么应主要依据公司章程和相关法律法规来处理。但在某些特殊情况下，如公司章程未对某些事项作出明确规定，而合伙协议中有相关约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么合伙人也可能依据合伙协议来主张权利。
实际操作中的建议：
- 在合伙后成立公司时，建议合伙人对合伙协议进行全面审查，确保其中的关键条款能够被公司章程所涵盖或替代，以避免未来可能出现的法律纠纷。
- 如果合伙协议中存在某些特殊约定，且这些约定对合伙人来说非常重要，那么可以在公司章程中明确保留这些约定的效力，或者通过其他方式（如签订补充协议）来确保这些约定的执行。
- 在发生纠纷时，建议合伙人首先尝试通过协商、调解等方式解决纠纷。如果协商、调解无果，再考虑通过法律途径解决。在提起诉讼时，应仔细分析纠纷的性质和法律依据，选择合适的法律文件（如合伙协议或公司章程）作为起诉的依据。
举例说明：假设甲、乙、丙三人签订了一份合伙协议，约定共同出资设立一家企业，并明确了各自的出资比例、利润分配方式等。后来，三人决定将合伙企业转化为有限责任公司，并制定了公司章程。但在公司章程中，并未对利润分配方式作出明确规定。此时，如果甲、乙、丙三人之间因利润分配问题发生纠纷，且合伙协议中的利润分配方式不违反法律法规的强制性规定，那么甲、乙、丙三人仍可能依据合伙协议中的利润分配方式来主张权利。
法律背景与建议：根据《中华人民共和国公司法》和《中华人民共和国合伙企业法》的相关规定，合伙人和股东在处理纠纷时，应优先依据公司章程和相关法律法规来处理。但在特定情况下，如合伙协议中的约定未被公司章程所涵盖或替代，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么合伙人仍可能依据合伙协议来主张权利。因此，在处理此类纠纷时，建议合伙人仔细分析纠纷的性质和法律依据，选择合适的法律文件作为起诉的依据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。