针对您提出的“施工合同无效，为施工合同作担保的保证人如何承担责任”的问题，这是一个涉及合同法和担保法的重要法律问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、担保合同无效的一般原则
首先，需要明确的是，担保合同通常具有从属性，其效力依附于主合同（即施工合同）。因此，当施工合同被判定为无效时，原则上担保合同也随之无效。这意味着，在一般情况下，如果担保人对于主合同的无效状态没有过错，那么担保人不再承担基于无效担保合同的担保责任。
二、担保人承担责任的特殊情况
然而，在特定情况下，担保人可能需要承担一定的民事责任。这主要取决于担保人是否存在过错以及具体的法律规定：
担保人存在过错：
- 如果担保人在明知施工合同存在违法或无效情形的情况下，仍然提供担保，那么担保人需要承担一定的民事责任。这种责任通常不超过债务人（即施工合同的债务人）不能清偿部分的三分之一。这是因为担保人对主合同的无效状态存在过错，应当根据其过错承担相应的责任。
担保人与债务人恶意串通：
- 在极端情况下，如果担保人与债务人存在恶意串通、共同欺诈等不正当关系，以骗取债权人的信任或利益，那么担保人可能与债务人承担连带责任。这意味着债权人可以向担保人追索全部或部分损失。
担保合同本身存在瑕疵：
- 担保合同可能因主体不合格、担保事由违法、抵押物或质押标的违法等原因而无效。在这种情况下，担保人是否承担责任同样取决于其是否存在过错。如果担保人尽到了合理的审查义务，但因不可抗力或其他非自身原因无法知晓担保合同的无效情形，则通常无需承担民事责任。
三、实际操作中的建议
谨慎审查合同：
- 担保人在提供担保前，应仔细审查施工合同的内容，确保其合法性和有效性。这包括审查合同条款、双方资质、合同目的等，以避免因主合同无效而卷入不必要的法律纠纷。
明确约定责任范围：
- 在担保合同中，应明确约定担保人的责任范围和免责条款。这有助于在发生争议时，为担保人提供明确的法律依据和保护。例如，可以约定担保人在特定情况下不承担责任或承担有限的责任。
咨询专业律师：
- 在处理涉及担保的复杂法律问题时，建议担保人及时咨询专业律师。律师将根据案件的具体事实、相关法律法规以及司法解释，进行综合分析并给出专业的法律意见。这有助于担保人更好地了解自己的权利和义务，避免潜在的法律风险。
综上所述，当施工合同无效时，为施工合同作担保的保证人的责任取决于其是否存在过错以及具体的法律规定。在实际操作中，担保人应谨慎审查合同、明确约定责任范围，并在必要时咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。