结论：发3月工资但未缴纳社保而申报个税的行为，不合法。具体分析如下：

1. 社保缴纳的强制性
   根据《社会保险法》第五十八条，用人单位应当自用工之日起30日内为员工办理社保登记，并按时足额缴纳社保费用（包括养老、医疗、失业、工伤、生育保险）。即使员工同意不缴纳社保，该约定也因违反法律强制性规定而无效。因此，未缴纳社保的行为本身已违法，与是否申报个税无关。

2. 个税申报与社保缴纳的独立性
   个税申报是依据《个人所得税法》的义务，用人单位需在发放工资时代扣代缴员工个人所得税，并向税务机关申报。但个税申报的合法性不因社保未缴纳而改变，两者分属不同法律关系。未缴纳社保不会导致个税申报违法，但会单独构成社保违法行为。

3. 法律后果

   • 社保未缴纳：社保部门可责令补缴，并加收滞纳金（每日万分之五）；逾期不缴的，可能被处以欠缴数额1-3倍罚款（《社会保险法》第八十六条）。
     
   • 个税申报：若用人单位未依法代扣代缴个税，税务机关可对单位处应扣未扣税款50%-3倍罚款（《税收征收管理法》第六十九条）；员工也可能因未申报收入面临补税、滞纳金及罚款风险。

4. 实务建议

   • 对用人单位：立即补缴社保，避免滞纳金和罚款累积；同步检查个税申报是否准确，确保税款足额代扣代缴。
     
   • 对员工：若发现单位未缴社保，可向当地社保部门投诉（如12333热线），要求单位补缴；若单位未代扣个税，需自行向税务机关申报并补缴，避免个人信用受损。

总结：未缴纳社保与申报个税是两个独立义务，前者违法但不影响后者合法性，但两者均需依法履行。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。