针对您提出的“三副证书被管理公司扣押，能不能补办”的问题，以下是我的详细解答：

首先，需要明确的是，三副适任证书是您的个人职业资格证书，其所有权和使用权均归您个人所有，管理公司无权扣押。如果您的三副证书确实被管理公司扣押，这可能涉及到公司管理不规范或违法行为，您有权要求公司归还证书。

若公司拒绝归还，或者您因其他原因遗失了证书，您是有权向相关海事管理机构申请补办的。补办流程一般如下：

1. 准备材料：

   • 您需要准备个人身份证明（如身份证、护照等）的复印件。
   • 填写并提交适任证书补办申请表，说明证书遗失或被扣押的情况。
   • 如果可能，提供证书遗失或被扣押的证明材料，如报警记录、公司扣押证明等（虽非必需，但有助于加快办理进程）。

2. 提交申请：

   • 将准备好的材料提交至您所在地的海事管理机构或指定的证书办理窗口。
   • 您也可以选择通过海事管理机构的官方网站或在线服务平台进行在线申请，具体流程和要求可参照当地海事管理机构的指南。

3. 审核与办理：

   • 海事管理机构会对您的申请材料进行审核，确认您的身份和证书情况。
   • 审核通过后，海事管理机构会为您补办新的三副适任证书，并通知您领取。

4. 注意事项：

   • 在补办证书期间，您可能需要暂时无法从事需要该证书的工作，因此建议尽快办理。
   • 补办证书可能需要支付一定的费用，具体金额和支付方式可咨询当地海事管理机构。
   • 如果您的证书过期时间较长（如超过10年），根据相关规定，您可能还需要参加模拟器培训和知识更新培训，并通过相应的理论考试和项目评估，以及完成船上见习等要求，才能重新获得有效的适任证书。但这一要求主要针对证书过期再有效的情况，与补办因遗失或被扣押而丢失的证书不完全相同，具体可咨询当地海事管理机构以确认。

额外建议：

• 在与管理公司沟通时，保持冷静和理性，明确表达您的诉求和权益。
• 如果公司行为涉嫌违法，您可以考虑向当地劳动监察部门或海事管理机构投诉，以维护自己的合法权益。
• 在未来的工作中，建议妥善保管好自己的职业资格证书和其他重要文件，避免类似情况再次发生。

希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时咨询。