关于您父亲耕地被私自挖掘所造成的损失计算问题，这通常涉及多个方面，包括土地本身的损失、农作物损失以及可能的恢复费用等。以下是从不同角度对损失计算的分析：
土地本身损失的计算：
- 土地损失通常难以直接量化其市场价值，但可以考虑土地的使用价值、肥沃程度、地理位置等因素进行估算。若该土地有明确的承包经营权或使用权证书，且证书上注明了土地面积和用途，这可以作为计算损失的基础。
- 在没有直接市场价值参考的情况下，可以参考当地类似土地的使用权转让价格或租金水平，结合被挖掘土地的面积和受损程度，来估算土地损失。不过，由于这是私自挖掘行为，且发生在2011年，直接的市场参考可能难以获取，因此这种估算可能存在一定的主观性。
农作物损失的计算：
- 如果被挖掘的土地上当时种植了农作物，那么农作物的损失也是计算损失的重要部分。这包括农作物的直接损失（如被挖掘导致的农作物死亡或减产）和间接损失（如因农作物减产而导致的未来收益减少）。
- 农作物直接损失的计算可以基于农作物的市场价格、种植成本以及受损程度来进行。例如，如果被挖掘的土地上种植了小麦，且小麦的市场价格为每斤X元，种植成本为每亩Y元，受损面积为100平方米（约0.15亩），那么可以估算出农作物的直接损失。
- 农作物间接损失的计算则可能更为复杂，需要考虑农作物的生长周期、预期产量、市场价格波动等因素。
农作物直接损失计算公式（以小麦为例）：
[
\text{农作物直接损失} = \text{受损面积(亩)} \times (\text{预期产量(斤/亩)} \times \text{市场价格(元/斤)} - \text{种植成本(元/亩)})
]
假设数据：受损面积0.15亩，预期产量800斤/亩，市场价格1.5元/斤，种植成本500元/亩。
[
\text{农作物直接损失} = 0.15 \times (800 \times 1.5 - 500) = 0.15 \times (1200 - 500) = 0.15 \times 700 = 105 \text{元}
]
恢复费用的计算：
- 被挖掘的土地可能需要一定的恢复费用，包括土地平整、土壤改良、重新种植等费用。这些费用可以根据实际的恢复需求和当地的市场价格来进行估算。
综合损失计算：
- 在考虑了土地本身损失、农作物损失以及恢复费用后，可以将这些损失相加，得到综合损失。不过，由于土地损失难以直接量化，且可能涉及复杂的法律评估，因此在实际操作中，可能需要借助专业的评估机构或法律程序来确定。
法律建议：
- 由于该事件发生在2011年，且涉及农村土地和宅基地问题，建议您首先收集相关证据，如土地承包经营权证书、现场照片、证人证言等，以证明土地被私自挖掘的事实和损失情况。
- 接着，您可以考虑与侵权方进行协商，寻求赔偿。如果协商无果，您可以向当地村委会、乡镇政府或相关部门反映情况，寻求帮助和支持。
- 最后，如果必要，您可以向法院提起诉讼，要求侵权方承担赔偿责任。在诉讼过程中，法院可能会委托专业的评估机构对损失进行评估，以确定具体的赔偿金额。
请注意，由于时间久远和具体情况的复杂性，损失的计算可能存在一定的困难和不确定性。因此，在实际操作中，建议您寻求专业法律人士的帮助和支持，以确保您的权益得到妥善维护。如果您有任何进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。