用他人的土地承包合同申请办理登记并取得了土地承包经营权证的行为，属于违法行为，可能涉及欺诈、伪造公文证件印章以及非法侵占他人权益等法律问题。以下是对此问题的详细分析：

1. 欺诈行为：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，以非法占有为目的，用虚构事实或者隐瞒真相的方法，骗取数额较大的公私财物的行为，构成诈骗罪。在此情况下，使用他人的土地承包合同申请办理登记，并取得土地承包经营权证，实际上是通过欺骗手段获取了本应属于他人的权益，具有欺诈性质。
   • 法律后果：如果该行为被认定为诈骗，且数额较大，行为人可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役或罚金等。

2. 伪造公文证件印章行为：

   • 法律背景：如果行为人在申请办理登记过程中，伪造了土地承包合同或其他相关公文、证件、印章，那么该行为还可能构成伪造公文证件印章罪。根据《中华人民共和国刑法》的规定，伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
   • 法律后果：行为人可能因伪造公文证件印章而面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、管制或罚金等，具体刑罚取决于伪造行为的严重程度和造成的后果。

3. 非法侵占他人权益：

   • 法律背景：土地承包经营权是农民的重要财产权益，受法律保护。未经合法授权，擅自使用他人的土地承包合同申请办理登记并取得土地承包经营权证，实际上是对他人财产权益的非法侵占。
   • 法律后果：行为人可能需要承担民事责任，包括返还非法取得的土地承包经营权证、赔偿因侵占行为给原权利人造成的损失等。同时，如果该行为构成犯罪，行为人还可能面临刑事处罚。

建议与后续行动：

• 立即停止违法行为：如果行为人已经实施了上述违法行为，应立即停止，并主动向相关部门说明情况，配合调查处理。
• 寻求法律帮助：由于此类问题涉及复杂的法律关系和可能的刑事责任，建议行为人尽快咨询专业律师，了解自身权利和义务，以及可能面临的法律后果。
• 积极配合调查：如果相关部门已经介入调查，行为人应积极配合，如实陈述事实，提供相关证据，以便尽快查明真相，减轻或避免法律责任。

总结与提醒：

土地承包经营权是农民的重要财产权益，受法律严格保护。任何未经合法授权擅自使用他人土地承包合同申请办理登记并取得土地承包经营权证的行为，都是违法的，并可能面临严重的法律后果。因此，建议广大农民朋友在办理相关手续时，务必遵守法律法规，确保自身行为的合法性。如有任何疑问或需要帮助，请随时向我咨询。