在工资支付争议中，举证责任主要由用人单位承担，但劳动者也需承担一定的初步举证责任。以下是对此问题的详细解析：

用人单位举证责任

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第六条的规定，发生劳动争议时，与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；不提供的，应当承担不利后果。
   • 《工资支付暂行规定》第六条第三款也明确要求用人单位必须书面记录并保存工资支付的相关情况，以备查证。

2. 适用情形：

   • 工资发放记录、考勤记录、加班审批记录等由用人单位制作和保存的证据，在争议中应由用人单位提供。
   • 当用人单位作出减少劳动报酬等决定时，根据最高人民法院《关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》的相关规定，用人单位同样负有举证责任，需证明其决定的合法性与合理性。

3. 案例说明：

   • 假设员工小王与公司发生工资支付争议，公司需提供工资支付凭证以证明已按时支付工资。若公司无法提供，则可能面临败诉风险。
   • 若公司以小李违反规定为由扣减工资，则需举证证明小李的违规行为及扣减依据的合法性，否则同样可能承担不利后果。

劳动者举证责任

1. 适用情形：

   • 劳动者需对自己提出的工资支付相关主张提供初步证据，如劳动合同、工资条、银行流水记录等，以证明劳动关系、工资标准及工作时间等基本事实。
   • 若劳动者主张加班工资，则需证明加班的时间、工作内容等，这可以通过提供考勤记录、工作日志、同事证言等方式来实现。

2. 案例说明：

   • 假设员工小张起诉公司未支付提成工资，他需提供劳动合同中关于提成的约定及业务成果证明等初步证据。若小张无法提供这些证据，则可能难以支持其主张。

特殊情况下的举证责任

• 在某些特殊情况下，如因用人单位作出的开除、除名、辞退、解除劳动合同、减少劳动报酬等决定而发生的劳动争议，举证责任可能会倒置给用人单位。即用人单位需承担证明其行为合法性的举证责任。

综合建议

• 用人单位：应建立健全的工资支付记录制度，确保工资支付凭证、考勤记录等关键证据的完整性和可追溯性。同时，在作出与工资相关的决定时，应确保决定的合法性与合理性，并保留相关证据以备查证。
• 劳动者：应积极收集并保存与工资支付相关的证据，如劳动合同、工资条、银行流水记录等。在发生争议时，应及时向用人单位提出异议，并寻求法律援助或咨询专业律师以维护自己的合法权益。

在实际操作中，双方应充分理解并遵守相关法律法规的规定，积极提供证据以支持各自的主张。若遇到复杂的工资支付争议问题，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。