关于机关单位退休人员违纪被处理降低二级待遇的起算时间，需分情况讨论，具体如下：
若处理决定中明确规定了降低待遇的起算时间：
- 一般情况下，应遵循处理决定中的明确规定。例如，处理决定可能明确指出“自某年某月某日起，降低该退休人员二级待遇”。这种情况下，起算时间就是处理决定中指定的日期。
若处理决定中未明确规定降低待遇的起算时间：
- 从处理决定生效之日起算：在缺乏明确起算时间的情况下，通常认为降低待遇的处理应从处理决定生效之日起开始执行。处理决定的生效日期可能是决定作出之日，也可能是决定送达退休人员之日，具体取决于相关法律法规或单位内部规定。
- 考虑退休人员实际知晓时间：虽然处理决定生效是降低待遇的前提，但还需考虑退休人员实际知晓处理决定的时间。如果退休人员因某种原因未能及时收到处理决定，且该延迟非因其自身原因造成，那么在实际知晓处理决定后的一段时间内（如合理期限内），可能不应立即执行降低待遇的决定。不过，这一原则的具体应用需结合具体情况和相关法律法规进行判断。
- 参考相关法律法规或单位内部规定：不同机关单位可能有不同的内部规定或操作流程，这些规定或流程可能对降低待遇的起算时间有具体说明。因此，在缺乏明确处理决定的情况下，应参考相关法律法规或单位内部规定来确定起算时间。
法律背景与建议：
- 机关单位退休人员违纪被处理降低待遇的问题，通常涉及《公务员法》、《行政机关公务员处分条例》等相关法律法规。这些法律法规对公务员的处分种类、程序、期限以及待遇调整等方面都有明确规定。
- 在处理此类问题时，建议机关单位应严格按照相关法律法规和单位内部规定执行，确保处理决定的合法性和合理性。同时，也应注重保护退休人员的合法权益，避免因处理不当而引发不必要的法律纠纷。
- 如果退休人员对处理决定有异议，可以依法提出申诉或复核申请。在申诉或复核过程中，退休人员应提供充分的证据和理由来支持自己的主张，以便机关单位或上级主管部门能够作出公正、合理的裁决。
可能存在的法律后果：
- 如果机关单位未按照相关法律法规和单位内部规定执行降低待遇的决定，可能会面临法律诉讼或行政复议等法律后果。这不仅会影响机关单位的声誉和形象，还可能给单位带来不必要的经济损失。
- 对于退休人员而言，如果认为自己的合法权益受到侵害，可以依法维护自己的权益。但如果退休人员采取不当手段进行维权，如扰乱公共秩序、诽谤他人等，也可能会面临法律责任。
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