在评标结束后发现存在串通投标的行为，这是一个需要严肃处理的问题。针对这一情况，以下是我为您提供的详细处理流程和建议：
一、串通行为的认定
首先，需要明确的是，串通投标行为的认定通常不是由原评标委员会直接进行的，尤其是在评标已经结束且投标有效期已过的情况下。根据《招标投标法实施条例》的相关规定，串通投标行为有明确的认定标准，如不同投标人的投标文件相互混装、投标报价呈规律性差异等。在本例中，两个投标人的保证金凭证混装，就符合了视为串通投标的情形之一。
二、报告与查处
向行政监督部门报告：招标人或相关利益方在发现串通投标行为后，应及时向当地的招标投标行政监督部门报告。报告时应提供详细的证据材料，包括但不限于投标文件、保证金凭证、评审记录等，以便行政监督部门进行调查。
行政监督部门查处：行政监督部门在接到报告后，会指定专人负责调查取证。调查过程中，会听取当事人的陈述和申辩，并确保调查程序的合法性和公正性。如果调查确认存在串通投标行为，行政监督部门将依法进行处罚。
三、处罚措施
根据《中华人民共和国政府采购法》的相关规定，对于恶意串通的行为，可以采取以下处罚措施：
罚款：对供应商处以采购金额千分之五以上千分之十以下的罚款。
列入不良行为记录名单：将供应商列入不良行为记录名单，并在一至三年内禁止其参加政府采购活动。
没收违法所得：如果供应商有违法所得，将一并没收。
吊销营业执照：对于情节严重的供应商，由工商行政管理机关吊销其营业执照。
追究刑事责任：如果串通投标行为构成犯罪，将依法追究相关责任人的刑事责任。
四、后续处理
重新招标或确定中标人：如果串通投标行为导致原中标结果无效，招标人应根据相关法律法规和招标文件的规定，重新组织招标或确定新的中标人。
加强监管与防范：招标人应加强对招标投标活动的监管，完善招标文件和评审标准，提高评审的公正性和透明度，以防范类似串通投标行为的发生。
综上所述，评标结束后发现串通投标行为，应及时向行政监督部门报告，由行政监督部门进行查处，并依法对违规供应商进行处罚。同时，招标人也应加强监管与防范，确保招标投标活动的公正性和合法性。