您好，关于单位离职档案里应该包含的离职证明，这是一个涉及劳动法规和档案管理的重要问题。以下是我为您详细梳理的解答：

首先，离职证明是劳动关系结束的重要凭证，它证明了您与前单位已经解除了劳动关系，并且是按照正常手续办理的离职。这份证明对于您未来的职业发展、社保转移、公积金提取等都有着至关重要的作用。

离职证明应包含的内容：

1. 基本信息：员工姓名、身份证号码，这是确认身份的关键信息。
2. 工作信息：入职日期、离职日期，所在部门、担任职务，这些信息能够清晰地反映您在前单位的工作经历。
3. 其他事项：如有竞业协议或其他需要特别交代的事项，也应在离职证明中明确说明。
4. 公章：离职证明必须加盖前单位的公章，以确保其法律效力。

离职证明的用途：

1. 证明劳动关系解除：向新单位或相关机构证明您与前单位已经解除了劳动关系。
2. 证明正常离职：表明您是按照正常手续办理的离职，而非被辞退或擅自离职。
3. 自由人证明：证明您现在是自由人，可以申请失业金或应聘新的职位。
4. 人事关系、社保、公积金转移：离职证明是办理这些手续的重要依据。

关于离职证明的数量和留存：

离职证明通常应该开2联，一联由公司留存，作为档案管理的依据；另一联则交给员工留存，以备不时之需。

如果离职证明缺失或无法提供：

1. 与原单位沟通：首先尝试与原单位沟通，说明情况并请求补开离职证明。
2. 劳动仲裁：如果原单位拒绝开具或无法联系到原单位，您可以通过劳动仲裁部门提出申诉，要求原单位出具离职证明。
3. 向新单位解释：在入职新单位时，如果无法提供离职证明，可以先向新单位解释清楚情况，并提供其他证明材料（如工资单、社保记录等）作为辅助证明。同时，可以写一个承诺函，承诺自己与前单位已经解除了劳动关系，并愿意承担由此产生的一切法律责任。

针对您提到的具体情况：

如果新单位要求提供第一家公司的离职证明原件，但该证明在第二家公司的入职资料里且第二家公司拒绝提供原件，您可以尝试与第二家公司协商，看是否能够提供复印件或加盖公章的证明文件。同时，也可以向新单位说明情况，并提供其他能够证明您与第一家公司已经解除劳动关系的材料。

总之，离职证明是离职档案中不可或缺的一部分，它对于您的职业发展和相关手续的办理都有着至关重要的作用。希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。