修改工资结构是否违法，关键在于是否遵循了法定程序并与劳动者协商一致。具体来说，我们可以从以下几个方面进行分析：
合法修改工资结构的情形
- 协商一致：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括工资结构。这意味着，如果公司在修改工资结构前与员工进行了充分沟通，并达成了书面一致意见，那么这种修改是合法的。
- 符合法律法规：修改后的工资结构必须符合国家及地方相关法律法规的要求，如最低工资标准、加班工资计算等。只要不违反这些规定，修改就是合法的。
- 基于合理经营需要：公司因市场变化、业务调整等合理经营需要，对工资结构进行合理调整，且调整后的薪资水平不低于当地最低工资标准，通常也被视为合法行为。
违法修改工资结构的情形
- 未经协商一致：如果公司单方面修改工资结构，未与员工进行协商或未达成一致意见，这种行为可能构成违法。员工有权要求公司恢复原工资结构，并可能主张经济补偿金。
- 违反法律法规：若修改后的工资结构违反了国家及地方相关法律法规，如降低基本工资至低于当地最低工资标准，或未按规定支付加班工资等，公司将面临法律责任，包括支付赔偿金和可能的行政处罚。
- 恶意降薪：公司以不合理的理由恶意降低员工薪资，损害员工合法权益的，也属于违法行为。员工可以要求公司补足工资差额，并主张经济补偿金。
面对公司修改工资结构的情况，员工可以采取以下措施来维护自己的权益：
- 与公司沟通协商：首先，员工应与公司的人力资源部门或上级领导进行沟通，了解修改工资结构的原因和依据，争取达成双方都能接受的解决方案。在沟通过程中，务必保留好所有相关的证据，如谈话记录、邮件往来、通知文件等。
- 向劳动监察部门投诉：若与公司的协商未能取得满意结果，员工可向当地劳动行政部门的劳动监察机构进行投诉，请求其介入调查并纠正公司的违法行为。
- 申请劳动仲裁或提起诉讼：当上述途径均无法解决问题，且公司的修改行为确实违反了劳动合同的约定或法律法规时，员工可选择向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或直接向人民法院提起诉讼。在申请仲裁或提起诉讼前，员工需准备充分的证据材料，包括但不限于劳动合同、工资单、银行工资流水明细、公司修改工资结构的通知或文件、与公司沟通协商的记录等。
经济补偿金的计算（如适用）：
如果员工因公司违法修改工资结构而主张经济补偿金，其计算通常按照员工在公司的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。这里的“月工资”是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
综上所述，修改工资结构是否违法取决于是否遵循了法定程序并与劳动者协商一致。员工在面对公司修改工资结构的情况时，应保持冷静理性，采取合法有效的措施进行维权，并确保保留好所有相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。