针对您提出的问题“夫妻一方中标，另一方不知情，在自己父亲家庭中摇号，中签会被取消么”，以下是我的详细解答：
首先，我们需要明确的是，在北京市的小客车指标摇号过程中，家庭申请人的亲属关系和婚姻状况是需要进行严格核查的。这一核查工作由本市公安部门和民政部门分别负责，以确保申请信息的真实性和准确性。
关于婚姻状况的核查：
- 如果家庭申请人的婚姻状况存在疑问，例如婚姻登记年份早于2004年、婚姻登记地为外省（区、市）或在法院办理离婚等情况，小客车指标网站会提示相关申请人携带材料前往民政部门设置的窗口进行现场核查。
- 在您描述的情况中，如果夫妻一方在不知情的情况下，另一方在其父亲家庭中摇号并中签，而婚姻状况核查过程中发现存在隐瞒或虚假信息，那么中签资格很可能会被取消。因为家庭申请人填报的申请信息应当真实、准确，对所填报信息的真实性负责。
关于亲属关系的核查：
- 公安部门会对家庭主申请人和其他家庭申请人的亲属关系进行核查。如果核查过程中发现亲属关系不真实或存在疑问，同样会影响中签资格。
- 在您的情况中，如果另一方在其父亲家庭中摇号，但并未如实申报与您的婚姻关系，或者家庭成员关系存在混淆，这也可能导致中签资格被取消。
关于中签后的处理：
- 如果中签后被发现存在虚假信息或隐瞒情况，不仅中签资格会被取消，还可能面临一定的法律责任和信用惩戒。
- 此外，家庭主申请人获得指标后的十年以内，所有家庭申请人不得再次办理配置指标申请登记。
综合建议：
- 如实申报信息：在参与小客车指标摇号时，务必如实申报所有家庭申请人的信息，包括婚姻状况和亲属关系等。
- 关注核查进展：如果被通知需持相关材料到现场进行核查，请按提示及时办理，以确保核查工作的顺利进行。
- 遵守相关规定：严格遵守北京市小客车数量调控的相关规定和政策要求，避免因违规行为而影响中签资格或面临法律责任。
总之，如果夫妻一方在不知情的情况下，另一方在其父亲家庭中摇号并中签，而婚姻状况或亲属关系核查过程中发现存在隐瞒或虚假信息，那么中签资格很可能会被取消。因此，建议所有家庭申请人在参与摇号时务必如实申报信息并遵守相关规定。