结论：无烟草专卖零售许可证而参与合作经营超市并销售烟草的行为，可能面临行政处罚，并且在特定情况下可能需要承担民事赔偿责任，甚至可能涉及刑事责任。以下是对此问题的详细分析：
行政责任：
- 根据《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例，经营烟草制品零售业务必须取得烟草专卖零售许可证。无照经营烟草制品零售业务属于违法行为，烟草专卖行政主管部门有权对其进行查处，包括责令停止经营烟草制品零售业务，没收违法所得，并处以罚款。
- 在合作经营超市的情境中，如果无照的一方直接参与烟草销售活动，那么该方将直接承担上述行政责任。即使无照方不直接参与销售，但如果其以合作、入股等方式间接参与超市经营，并从中获取利益，也可能被视为共同违法者，承担相应的行政责任。
民事责任：
- 如果因无照销售烟草导致消费者或其他第三方受损（如因购买到假冒伪劣烟草产品而遭受健康损害），无照方可能需要承担民事赔偿责任。这取决于无照方在合作经营中的具体角色、行为以及损害结果之间的因果关系。
- 在合作经营中，如果无照方与有照方之间存在明确的分工，且无照方负责烟草销售或相关管理工作，那么无照方在民事赔偿方面的责任可能会更大。
刑事责任（在特定情况下）：
- 如果无照销售烟草的行为情节严重，构成非法经营罪或其他相关犯罪，无照方还可能面临刑事责任。这通常涉及销售金额巨大、销售假冒伪劣烟草产品、逃避监管等严重情节。
- 在合作经营中，如果无照方与有照方共同实施了犯罪行为，那么双方都可能被追究刑事责任。
建议：
- 对于无照方而言，应立即停止参与任何与烟草销售相关的活动，并尽快办理烟草专卖零售许可证（如果符合条件）或退出与烟草销售相关的合作经营。
- 对于有照方而言，应审查合作协议，明确双方的权利义务，特别是关于烟草销售的部分。如果无照方继续参与烟草销售活动，有照方应考虑终止合作或采取其他措施以避免法律风险。
- 双方应咨询专业律师，了解具体的法律责任和风险，并制定相应的应对策略。
后续行动：如果您或您的合作伙伴在合作经营超市过程中遇到类似问题，或者有任何其他法律疑问，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供详细的法律建议和解决方案。