限期整改通知书若存在重大违法瑕疵，确实可以要求撤销。以下从几个角度详细分析这一问题：
一、法律依据与撤销理由
程序违法：如果限期整改通知书的发出程序存在重大违法，比如未依法送达、未告知当事人陈述申辩权利等，这构成了程序上的瑕疵。根据《行政处罚法》等相关法律法规，行政机关在作出行政行为时，必须遵循法定程序，否则该行政行为可能因程序违法而被撤销。
实体违法：若限期整改通知书的内容本身存在违法，比如要求整改的事项超出了法律、法规规定的范围，或者整改要求不合理、无法实现等，这也构成了实体上的瑕疵。在这种情况下，当事人有权要求撤销该通知书，因为行政机关的行政行为必须合法、合理。
滥用职权：如果行政机关在发出限期整改通知书时存在滥用职权的行为，比如出于不正当目的、恶意打压等，这也构成了撤销该通知书的理由。滥用职权是行政行为违法的一种形式，当事人可以通过法律途径维护自己的合法权益。
二、撤销途径与程序
行政复议：当事人可以在收到限期整改通知书后，依法向作出该通知书的行政机关的上一级机关申请行政复议。在行政复议过程中，当事人可以提出该通知书存在重大违法瑕疵的理由，并要求撤销。行政复议机关将对当事人的申请进行审查，并作出复议决定。
行政诉讼：如果当事人对行政复议决定不服，或者行政机关未在法定期限内作出复议决定，当事人可以依法向人民法院提起行政诉讼。在行政诉讼中，当事人可以进一步阐述该通知书存在重大违法瑕疵的理由，并请求法院判决撤销。
三、实际操作建议
收集证据：在要求撤销限期整改通知书时，当事人应首先收集相关证据，证明该通知书存在重大违法瑕疵。这些证据可以包括通知书本身、送达回证、相关法律法规条文、专家意见等。
咨询专业律师：虽然我在这里为你提供了一些法律分析和建议，但每个具体案件的情况都有所不同。因此，在实际操作中，我建议你直接向我咨询，以便我能根据你的具体情况提供更详细、更准确的法律意见。
注意时效：无论是申请行政复议还是提起行政诉讼，都需要注意时效问题。一般来说，行政复议的申请期限为知道该行政行为之日起六十日内，而行政诉讼的起诉期限则为知道或应当知道该行政行为之日起六个月内。因此，当事人应及时行使自己的权利，以免错过时效。
综上所述，限期整改通知书若存在重大违法瑕疵，当事人确实可以要求撤销。在实际操作中，当事人应收集相关证据、咨询专业律师并注意时效问题。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。