企业纪委对拖欠农民工工资举报的处理方式主要取决于企业性质及内部规定，但通常包括以下核心流程：

1. 接收举报并初步核实
   企业纪委收到举报后，会首先对举报内容进行初步审查，确认是否属于其管辖范围（如涉及党员干部违纪、企业管理人员失职等）。若举报内容属实且涉及违规，纪委将启动正式调查程序。

2. 分类处理

   • 若企业为国有企业/事业单位：纪委需依据《中国共产党纪律处分条例》《国有企业领导人员廉洁从业若干规定》等，对涉事管理人员（尤其是党员干部）进行党纪政务处分，同时督促企业限期支付工资。
     
   • 若企业为民营企业：纪委（或内部监察部门）可能依据企业规章制度处理，但若涉及违法（如拒不支付劳动报酬罪），需移交公安机关立案侦查，纪委可同步建议企业整改并追究相关人员责任。

3. 协同劳动监察部门
   企业纪委通常无直接执法权，但会配合人社部门劳动监察大队的调查，提供内部证据（如财务记录、考勤表等），推动问题解决。若企业拒不整改，纪委可向上级党组织或国资监管部门报告。

4. 结果反馈与追责
   调查结束后，纪委会向举报人反馈处理结果（如工资支付情况、责任人处分等）。若构成犯罪，企业需承担刑事责任，相关责任人可能面临有期徒刑或罚金。

农民工维权建议：

• 保留劳动合同、工资条、欠薪证据（如录音、聊天记录）；
  
• 优先向当地劳动监察大队投诉（时效快）；
  
• 若企业有党组织，可同步向纪委举报管理人员失职；
  
• 涉及金额较大或恶意拖欠，可直接向法院申请支付令或提起民事诉讼。
  

如有具体案件细节（如企业性质、欠薪金额等），可进一步向我咨询，我会结合法规为您分析维权路径。