根据《医师法》及相关法律规定，针对违法行医行为，对医疗机构（如诊所、药店等）的处罚需结合具体违法情形确定，主要处罚类型及适用情形如下：

1. 未取得《医疗机构执业许可证》擅自执业

• 处罚依据：《医师法》第五十九条、《基本医疗卫生与健康促进法》第九十九条。
• 处罚内容：
  • 责令停止执业活动；
  • 没收违法所得及药品、医疗器械；
  • 罚款：违法所得不足1万元的，按1万-10万元处罚；违法所得≥1万元的，处违法所得5-20倍罚款；
  • 对直接责任人员（如药店负责人）暂停执业活动1个月至1年，或吊销执业证书。
• 典型情形：药店未申请《医疗机构执业许可证》即开展诊疗、注射、手术等医疗行为。

2. 使用非卫生技术人员从事医疗卫生技术工作

• 处罚依据：《医师法》第五十八条、《医疗机构管理条例》第四十七条。
• 处罚内容：
  • 责令限期改正；
  • 罚款：1万-10万元；
  • 拒不改正的，责令停业整顿1-6个月，直至吊销《医疗机构执业许可证》。
• 典型情形：药店雇佣无医师资格的人员坐诊、开处方，或护士独立从事诊疗活动。

3. 超出登记范围执业

• 处罚依据：《医疗机构管理条例》第四十六条、《医师法》第五十七条。
• 处罚内容：
  • 警告、没收违法所得；
  • 罚款：1万-10万元；
  • 情节严重的，吊销《医疗机构执业许可证》或责令停止执业活动。
• 典型情形：药店登记范围为“零售药品”，但实际开展中医诊疗、静脉注射等超出范围的服务。

4. 出租、出借《医疗机构执业许可证》

• 处罚依据：《医师法》第五十九条第三款。
• 处罚内容：
  • 没收违法所得；
  • 罚款：1万-10万元；
  • 情节严重的，吊销《医疗机构执业许可证》。
• 典型情形：药店将《医疗机构执业许可证》出租给他人开设“分店”或合作经营。

5. 其他严重违法行为（如造成患者伤害）

• 处罚依据：《刑法》第三百三十六条（非法行医罪）、《医师法》第六十条。
• 处罚内容：
  • 行政处罚：吊销《医疗机构执业许可证》，对责任人暂停执业或吊销证书；
  • 刑事责任：若构成非法行医罪，对直接责任人员处3年以下有期徒刑、拘役或管制；严重损害健康或死亡的，处3-10年或10年以上有期徒刑。
• 典型情形：药店非法行医导致患者重伤、死亡，或使用假药、劣药造成严重后果。

补充说明

• 处罚对象：既包括医疗机构（如药店），也包括直接负责的主管人员和其他责任人员。
• 程序要求：卫生健康行政部门需依法调查取证，作出处罚决定前应告知当事人陈述、申辩权利。
• 救济途径：对处罚不服的，可申请行政复议或提起行政诉讼。

建议：若您的药店涉及上述情形，需立即停止违法行医行为，配合调查并整改。具体处罚需结合违法情节、后果严重性等因素综合判定，如有疑问可进一步向我咨询细节。