针对多家店非法行医的处罚，需根据具体违法情节、法律适用及行政/刑事责任划分综合判定，处罚方式包括行政处罚与刑事处罚两类，具体如下：
一、行政处罚（针对未达刑事犯罪标准的非法行医行为）
根据《中华人民共和国基本医疗卫生与健康促进法》第九十九条及《中华人民共和国医师法》第五十九条，若多家店铺存在以下行为，卫生健康行政部门可对每家店铺单独处罚：
未取得《医疗机构执业许可证》擅自执业：
- 处罚措施：没收违法所得及药品、医疗器械，并处违法所得5-20倍罚款（违法所得不足1万元的，按1万元计算）；
- 特殊情形：若店铺同时使用非卫生技术人员从事医疗卫生技术工作，需额外处罚（如暂停执业活动、吊销执业证书等）。
超出登记范围执业：
- 处罚措施：警告、责令改正，没收违法所得，并处1-10万元罚款；情节严重的，吊销《医疗机构执业许可证》。
其他非法行医情形（如伪造、变造、买卖、出租、出借《医疗机构执业许可证》）：
- 处罚措施：没收违法所得，处违法所得5-20倍罚款（违法所得不足1万元的，按1万元计算），并吊销《医疗机构执业许可证》。
关键点：若多家店铺为同一主体（如连锁店）或存在共同组织、策划非法行医行为，可能被认定为“情节严重”，处罚力度会加重（如罚款倍数提高、吊销许可证等）。
二、刑事处罚（针对构成犯罪的非法行医行为）
根据《中华人民共和国刑法》第三百三十六条，若非法行医行为符合以下条件，可能构成“非法行医罪”：
- 主体要件：未取得医生执业资格的人（包括无《医师资格证书》《医师执业证书》或《医疗机构执业许可证》的个人或单位）；
- 行为要件：擅自从事医疗活动（如诊断、治疗、开药、手术等）；
- 结果要件：情节严重（如造成就诊人轻度残疾、器官组织损伤导致一般功能障碍，或造成3人以上感染等）或严重损害就诊人健康（如造成就诊人中度残疾、器官组织损伤导致严重功能障碍，或造成1人以上重伤、死亡等）。
处罚标准：
- 情节严重：处3年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或单处罚金；
- 严重损害就诊人健康：处3-10年有期徒刑，并处罚金；
- 造成就诊人死亡：处10年以上有期徒刑，并处罚金。
关键点：若多家店铺为同一主体或存在共同犯罪行为（如分工合作、提供场地、资金支持等），可能被认定为“共同犯罪”，各参与者均需承担刑事责任。
三、其他法律责任
- 民事赔偿：若非法行医导致患者人身损害，患者可依据《中华人民共和国民法典》要求店铺承担医疗损害赔偿责任（包括医疗费、误工费、残疾赔偿金等）；
- 信用惩戒：非法行医行为可能被纳入“信用中国”等平台，影响店铺及责任人的社会信用评价。
建议：若您发现多家店铺存在非法行医行为，可向当地卫生健康行政部门举报（如拨打12320卫生热线），或直接向公安机关报案（若涉嫌犯罪）。若您是受害者，建议尽快收集证据（如诊疗记录、付款凭证、证人证言等）并咨询律师，通过法律途径维护权益。